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Enregistrement W2519910717

TCDD Disrupts Gene Expression in the Developing Mouse Kidney

2008· dissertation· en· W2519910717 sur OpenAlexfundno aff
Elizabeth Jane MacAulay

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2008
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGene expressionGeneBiologyExpression (computer science)Cell biologyComputational biologyGeneticsComputer science
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dioxins such as the potent 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) are persistent environmental contaminants, exposure to which results in a number of toxic effects in several species. In mice, TCDD-induced hydronephrosis of the kidney is among the most sensitive of developmental abnormalities. It is widely accepted that the toxic effects of dioxins such as TCDD are mediated by the aryl hydrocarbon receptor (AHR), a ligand-activated transcription factor expressed in virtually all tissues. Though it is known that activation of the AHR during development is likely the first step in TCDD-induced hydronephrosis, genetic events occurring downstream of AHR activation remain to be elucidated. To this end, we investigated the effect of TCDD on gene expression during development of the mouse kidney through use of expression arrays. Our analysis indicates that TCDD alters the expression of genes involved in the developmentally-critical Wnt signaling pathway and genes involved in cell cycle and cell proliferation. Further investigation of the effect of TCDD on Wnt pathway gene expression using an mRNA expression time course and in situ hybridization to characterize localized mRNA changes suggests that TCDD inhibits canonical Wnt signaling in the developing kidney. Consistent with our expression array finding that TCDD downregulates genes involved in cell proliferation, we also report a decrease in cell proliferation that coincides with regions of the kidney where inhibitors of canonical Wnt signaling are induced in response to TCDD. TCDD-induced disruption of Wnt pathway gene expression is not limited to the kidney, and alteration of Wnt gene expression is tissue-specific with varying effects observed in the heart, lung, liver, skin, and brain. Preliminary evidence also indicates that exposure to TCDD during development can alter the expression of microRNAs predicted to target Wnt pathway genes, suggesting a new mechanism for TCDD-induced disruption of gene expression. Taken together, our findings suggest that TCDD may disrupt an important pathway that is critical to the normal development of several organs in numerous species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,235
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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