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Enregistrement W2520119998 · doi:10.1016/j.chom.2016.08.006

Resistance of Transmitted Founder HIV-1 to IFITM-Mediated Restriction

2016· article· en· W2520119998 sur OpenAlexaff
Toshana L. Foster, Harry Wilson, Shilpa S. Iyer, Karen P. Coss, Katie J. Doores, Sarah E. Smith, Paul Kellam, Andrés Finzi, Persephone Borrow, Beatrice H. Hahn, Stuart J. D. Neil

Notice bibliographique

RevueCell Host & Microbe · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFogarty International CenterNational Institutes of HealthWellcome Trust
Mots-clésBiologyVirologyGlycoproteinVirusTransmembrane proteinViral envelopeCo-receptorInterferonViral entryHuman immunodeficiency virus (HIV)Viral replicationGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interferon-induced transmembrane proteins (IFITMs) restrict the entry of diverse enveloped viruses through incompletely understood mechanisms. While IFITMs are reported to inhibit HIV-1, their in vivo relevance is unclear. We show that IFITM sensitivity of HIV-1 strains is determined by the co-receptor usage of the viral envelope glycoproteins as well as IFITM subcellular localization within the target cell. Importantly, we find that transmitted founder HIV-1, which establishes de novo infections, is uniquely resistant to the antiviral activity of IFITMs. However, viral sensitivity to IFITMs, particularly IFITM2 and IFITM3, increases over the first 6 months of infection, primarily as a result of neutralizing antibody escape mutations. Additionally, the ability to evade IFITM restriction contributes to the different interferon sensitivities of transmitted founder and chronic viruses. Together, these data indicate that IFITMs constitute an important barrier to HIV-1 transmission and that escape from adaptive immune responses exposes the virus to antiviral restriction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations181
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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