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Enregistrement W2520357693 · doi:10.5376/gab.2016.07.0005

Research on HBV Gene Integration into Host Genome that is Related to HBV DR Region

2016· article· en· W2520357693 sur OpenAlexvenueno aff
Luo Haoxiang, Long Gu, Lihong He

Notice bibliographique

RevueGenomics and Applied Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyHost (biology)GeneGenomeBiologyHepatitis B virusGeneticsComputational biologyVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In most studies, the HBV DNA has been found integrated into the DNA of the hepatocellular carcinoma cells, the integrated HBV DNA is related to HBV DR region, in order to research how HBV integrated into the genome of the cells via HBV DR region, we isolated HBV Creg DNA fragment which is from nt1087 to nt2488 contained the DR region, regulatory sequence, X gene and C gene and constructed pcDNA3.1(+)-HBV Creg eukarya expression vector, then transfected it into the HepG2 cells to observe the integration way of HBV. In this study, HBV Creg DNA fragment was isolated from HBV genome by recombinant PCR, in this DNA fragment, the DR region, regulatory sequence, X gene and C gene of HBV was included, then linked it to the vector pcDNA3.1(+) to construct the pcDNA3.1(+)-HBV Creg eukarya expression vector. We transfected the pcDNA3.1(+)-HBV Creg eukarya expression vector into HepG2 cells, in the process, the transfected cell lines were selected by G418, the total DNA of HepG2 cells was extracted to test the integration of HBV by PCR using different primers. The full length of HBV Creg DNA fragment contained DR region could only be detected by PCR before integration into cell genome, after the fragment integrated into HepG2 genome, the full length of HBV Creg DNA fragment had not been detected all the time, however, HBV X gene and HBV C gene could be detected respectively, for the reason of HBV DR region, it may integrate at DR1 or DR2 with the Creg DNA extending downstream or upstream though C gene or X gene. The HBV Creg fragment can integrate into HepG2 cells genome. And the integration of HBV is related to DR region, the way of HBV Creg DNA fragment integrated into HepG2 cells is from DR region to both sides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,536
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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