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Enregistrement W2520516651

In search of Broad Applicable, Small Molecule Inhibitors of Salmonella Biofilm Formation

2009· article· en· W2520516651 sur OpenAlexaboutno aff
Stijn Robijns, Hans Steenackers, Joost Janssens, Patrick Chaltin, Jos Vanderleyden, Sigrid C. J. De Keersmaecker

Notice bibliographique

RevueLirias (KU Leuven) · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmSalmonellaChemistryMicrobiologyBiologyBacteriaGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salmonella is an important cause of foodborne infections worldwide. A major difficulty in the battle against Salmonella is the fact that Salmonella can form biofilms on various biotic and abiotic surfaces, both in- and outside the host. Therefore, the inhibition of these biofilms could be an effective way to combat Salmonella. We are currently conducting a high-throughput screening (using the ‘Calgary Biofilm device’) of a compound library consisting of > 20.000 small molecules, in search of Salmonella biofilm inhibitors which are active at a broad temperature range and therefore have potential to be used both in- and outside the host. The compounds have a molecular weight between 200 and 500 dalton and are selected on their possible drug ability. The screening is executed both at 16 °C and 37 °C. We aim at identifying compounds that inhibit biofilm formation, without killing the bacteria. This way, the development of resistance is less likely. After screening of 16.000 compounds (80%), we identified 133 possible biofilm inhibitors. Subsequently the dose-response relationship of the ‘hits’ was determined, as well as the growth-influences of the compounds. The compounds with maximum biofilm inhibitory capacities and minimal growth influences, were studied further, both on prevention and destruction of biofilms from Salmonella and Pseudomonas. Using these results we identified 8 ‘lead’ families off which the “structure-activity relationship” will be determined aswell as the activity in different in vitro and in vivo testsystems. Finally the ‘Mode of Action’ of will be determined using reportergene studies and/or microarray analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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