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Enregistrement W2521571442 · doi:10.2135/cropsci2016.01.0001

Identification of QTLs Associated with Improved Resistance to Ascochyta Blight in an Interspecific Pea Recombinant Inbred Line Population

2016· article· en· W2521571442 sur OpenAlexafffundabout
Ambuj Bhushan Jha, Bunyamin Tar’an, Robert Stonehouse, Thomas D. Warkentin

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésAscochytaBiologyBlightQuantitative trait locusPopulationInbred strainSativumAgronomyPlant disease resistanceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ascochyta blight of pea ( Pisum sp.), caused by Peyronellaea pinodes , often results in serious yield losses. Some accessions of Pisum fulvum Sibth. & Sm. previously showed high levels of resistance and could be used as sources of new resistance genes. The objectives of this study were to develop a single nucleotide polymorphism (SNP)‐based linkage map and identify genomic regions associated with Ascochyta blight resistance. A population (PR‐19) consisting of 144 recombinant inbred lines (RILs) developed from a cross between P651 ( P . fulvum ) and Alfetta ( Pisum sativum L.) was used. These RILs were evaluated for Ascochyta blight resistance under field conditions in Saskatchewan, as well as under greenhouse conditions. The RILs were genotyped using an Illumina GoldenGate array panel of 1536 SNPs. A wide range of variation was observed in Ascochyta blight scores and other agronomic traits. Disease scores were positively correlated ( P < 0.001) with lodging and were negatively correlated ( P < 0.001) with days to flower, plant height, days to maturity, and grain yield. A total of 733 SNP markers were assigned to six linkage groups covering 682.1 cM of the pea genome. Nine quantitative trait loci (QTLs) were identified for Ascochyta blight resistance, which individually explained 7.5 to 28% of the total phenotypic variation. In addition, five QTLs each were identified for plant height, days to maturity, and grain yield, four QTLs for days to flower, and two QTLs for lodging. The QTL abIII‐1 was consistent across locations and years, whereas abI‐IV‐2 was significant at both locations in 2014. These QTLs can be utilized for development of molecular markers associated with Ascochyta blight resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,853
Score d'incertitude au seuil0,207

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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