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Enregistrement W2523361297 · doi:10.1002/ajmg.a.37940

Phenotype and genotype in 52 patients with Rubinstein–Taybi syndrome caused by <i>EP300</i> mutations

2016· article· en· W2523361297 sur OpenAlexaff
Patricia Fergelot, Martine van Belzen, Julien Van‐Gils, Alexandra Afenjar, Christine M. Armour, Benoı̂t Arveiler, Lex Beets, Lydie Bürglen, Tiffany Busa, Marie Collet, Julie Deforges, Bert B.A. de Vries, Elena Garrido, Nathalie Dorison, Juliette Dupont, Christine Francannet, Sixto García‐Miñáur, Elisabeth Gabau Vila, Samuel Gebré‐Medhin, Blanca Gener Querol, David Geneviève, Marion Gérard, Cristina Gervasini, Alice Goldenberg, Dragana Josifova, Katherine Lachlan, Saskia M. Maas, Bruno Maranda, Jukka S. Moilanen, Ann Nordgren, P. Parent, Julia Rankin, William Reardon, Marlène Rio, J. Roume, Adam Shaw, Robert Śmigiel, A Sojo, Benjamin D. Solomon, Agnieszka Stembalska, Constance T. R. M. Stumpel, F J Ortega Suárez, Paulien A. Terhal, Simon Thomas, Renaud Touraine, Alain Verloès, Catherine Vincent‐Delorme, Josephine Wincent, Dorien J.M. Peters, Oliver Bartsch, Lidia Larizza, Didier Lacombe, Raoul C. M. Hennekam

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital limb and hand anomalies
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRubinstein–Taybi syndromeBiologyMissense mutationGeneticsMicrocephalyPhenotypeCREB-binding proteinMutationIntellectual disabilityGeneGenotypeTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rubinstein-Taybi syndrome (RSTS) is a developmental disorder characterized by a typical face and distal limbs abnormalities, intellectual disability, and a vast number of other features. Two genes are known to cause RSTS, CREBBP in 60% and EP300 in 8-10% of clinically diagnosed cases. Both paralogs act in chromatin remodeling and encode for transcriptional co-activators interacting with >400 proteins. Up to now 26 individuals with an EP300 mutation have been published. Here, we describe the phenotype and genotype of 42 unpublished RSTS patients carrying EP300 mutations and intragenic deletions and offer an update on another 10 patients. We compare the data to 308 individuals with CREBBP mutations. We demonstrate that EP300 mutations cause a phenotype that typically resembles the classical RSTS phenotype due to CREBBP mutations to a great extent, although most facial signs are less marked with the exception of a low-hanging columella. The limb anomalies are more similar to those in CREBBP mutated individuals except for angulation of thumbs and halluces which is very uncommon in EP300 mutated individuals. The intellectual disability is variable but typically less marked whereas the microcephaly is more common. All types of mutations occur but truncating mutations and small rearrangements are most common (86%). Missense mutations in the HAT domain are associated with a classical RSTS phenotype but otherwise no genotype-phenotype correlation is detected. Pre-eclampsia occurs in 12/52 mothers of EP300 mutated individuals versus in 2/59 mothers of CREBBP mutated individuals, making pregnancy with an EP300 mutated fetus the strongest known predictor for pre-eclampsia. © 2016 Wiley Periodicals, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,511
Score d'incertitude au seuil0,309

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations122
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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