Tidying up the genus<i>Letharia</i>: introducing<i>L. lupina</i>sp. nov. and a new circumscription for<i>L. columbiana</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Western North America is the global centre of diversity forLetharia, a distinctive and cryptically diverse genus of lichenized fungi belonging to theParmeliaceae. The genus is characterized by a shrubby, fruticose habit and presence of vulpinic acid. Previous studies using multiple fungal nuclear loci revealed the existence of two distinct species-level lineages within the traditional concept ofL. vulpinaand four such lineages withinL. columbiana. Here we use molecular sequence data in an attempt to settle long-standing taxonomic issues in the genus. Our results confirm the widespread existence withinL. vulpinas. lat. of two distinct species-level groups, each forming a mutually exclusive partnership with a separate algal clade withinTrebouxia jamesiis. lat. Accordingly, we formally describe the segregate speciesL. lupinasp. nov. Our results also support the evolutionary independence of four candidate species previously circumscribed fromL. columbianas. lat. One of these lineages,L.‘gracilis’, has already received species recognition asL. gracilis, while a second,L.‘lucida’, is epitypified here againstL. columbianas. str. Based on results from species delimitation analyses under the multispecies coalescent model, the two remaining lineages,L.‘barbata’ andL.‘rugosa’, also warrant formal taxonomic recognition; however, we refrain from describing these species pending additional studies of diagnostic characters, ecological preference, and distributions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».