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Enregistrement W2524353190 · doi:10.1113/jp272762

Sequence determinants of subtype‐specific actions of KCNQ channel openers

2016· article· en· W2524353190 sur OpenAlexafffund
Alice Wang, Runying Yang, Harley T. Kurata

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPotassium channelChemistryPharmacologyVoltage-gated potassium channelPotassium channel blockerBiophysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

KEY POINTS: Retigabine is a KCNQ voltage-gated potassium channel opener that was recently approved as an add-on therapeutic for patients with drug-resistant epilepsy. Retigabine exhibits very little specificity between most KCNQ channel subtypes, and there is interest in generating more potent and specific KCNQ channel openers. The present study describes the marked specificity of ICA069673 for KCNQ2 vs. KCNQ3, and exploits this property to investigate determinants of KCNQ subtype specificity. ICA069673 acts on a binding site in the voltage-sensing domain that is distinct from the putative retigabine site in the channel pore. ICA069673 has two separable effects on KCNQ channel activity. We identify two channel residues required for subtype specificity of KCNQ channel openers and show that these are sufficient to generate ICA069673 sensitivity in KCNQ3. ABSTRACT: Retigabine (RTG) is the first approved anti-epileptic drug that acts via activation of voltage-gated potassium channels, targeting KCNQ channels that underlie the neuronal M-current. RTG exhibits little specificity between KCNQ2-5 as a result of conservation of a Trp residue in the pore domain that binds to the drug. The RTG analogue ICA-069673 ('ICA73') exhibits much stronger effects on KCNQ2 channels, including a large hyperpolarizing shift of the voltage-dependence of activation, an ∼2-fold enhancement of peak current and pronounced subtype specificity for KCNQ2 over KCNQ3. Based on ICA73 sensitivity of chimeric constructs of the transmembrane segments of KCNQ2 and KCNQ3, this drug appears to interact with the KCNQ2 voltage sensor (S1-S4) rather than the pore region targeted by RTG. KCNQ2 point mutants in the voltage sensor were generated based on KCNQ2/KCNQ3 sequence differences, and screened for ICA73 sensitivity. These experiments reveal that KCNQ2 residues F168 and A181 in the S3 segment are essential determinants of ICA73 subtype specificity. Mutations at either position in KCNQ2 abolish the ICA73-mediated gating shift, but preserve RTG sensitivity. Interestingly, A181P mutant channels show little ICA73-mediated gating shift but retain current potentiation by the drug. Mutations (L198F and P211A), which introduce these critical KCNQ2 residues at corresponding positions in KCNQ3, transplant partial ICA73 sensitivity. These findings demonstrate that RTG and ICA73 act via distinct mechanisms, and also reveal specific residues that underlie subtype specificity of KCNQ channel openers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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