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Enregistrement W2524998133 · doi:10.1186/s12977-016-0294-5

Proceedings of the Frontiers of Retrovirology Conference 2016

2016· article· en· W2524998133 sur OpenAlexaff
Irena Zurnic, Sylvia Hütter, Ute Lehmann, Nicole Stanke, Juliane Reh, Tobias Kern, Fabian Lindel, Gesche Gerresheim, Martin V. Hamann, Erik Müllers, Paul Lesbats, Peter Cherepanov, Erik Serrao, Alan Engelman, Dirk Lindemann, Claire da Silva Santos, Kévin Tartour, Andrea Cimarelli, Rya Burdick, Jianbo Chen, Jaya Sastri, Wei-Shau Hu, Vinay K. Pathak, Oliver T. Keppler, Karine Pradeau, Sylvia Eiler, Nicolas Lévy, Sarah Lennon, Sarah Cianférani, Stéphane Emiliani, Marc Ruff, Vincent Parissi, Sylvie Rato, Antonio Rausell, Miguel Muñoz, Amalio Telenti, Angela Ciuffi, Alexander Zhyvoloup, Anat Melamed, I.G. Anderson, Delphine Planas, János Kriston-Vizi, Robin Ketteler, Chen-Hsuin Lee, Andy Merritt, Petronela Ancuța, Charles R. M. Bangham, Ariberto Fassati, Anthony Rodari, Benoît Van Driessche, Mathilde Galais, Nadège Delacourt, Sylvain Fauquenoy, Caroline Vanhulle, Anna Kula, Arsène Burny, Olivier Rohr, Carine Van Lint, Thijs van Montfort, Renee van der Sluis, Dave Speijer, Ben Berkhout, Bo Meng, Andrzej Rutkowski, Neil Berry, Lars Dölken, Andrew Lever, Thomas Schuster, Benedikt Asbach, Ralf Wagner, Gross Christine, Veit Wiesmann, Martina Kalmer, Thomas Wittenberg, Jan Gettemans, Andrea K. Thoma‐Kress, Minghua Li, Eric O. Freed, Shan‐Lu Liu, J.Y. Muller, Jan Münch, Xaver Sewald, Pradeep D. Uchil, Mark S. Ladinsky, Jagadish Beloor, Ruoxi Pi, Christin Herrmann, Nasim Motamedi, Thomas T. Murooka, Michael A. Brehm, Dale L. Greiner, Thorsten R. Mempel, Pamela J. Björkman, Priti Kumar, Walther Mothes, Simone Joas, Erica H. Parrish, Clement W. Gnanadurai, Edina Lump, Christina M. Stürzel, Nicholas F. Parrish, Ulrike Sauermann, Katharina Töpfer, Tina Schultheiss, Steven E. Bosinger, Guido Silvestri, Cristian Apetrei, N. Huot, Michaela Müller‐Trutwin, Daniel Sauter, Beatrice H. Hahn, Christiane Stahl‐Hennig, Frank Kirchhoff, Gerald G. Schumann, Sabine Jung‐Klawitter, Nina V. Fuchs, Kyle R. Upton, Martín Muñoz-López, Ruchi Shukla, Jichang Wang, Marta García-Cañadas, Cesar Lopez‐Ruiz, Daniel J. Gerhardt, Attila Sebe, Ivana Grabundžija, Patricia Gerdes, Sylvia Merkert, Andrés Pulgarin, Anja Bock, Ulrike Held, Anett Witthuhn, Alexandra Haase, Ernst J. Wolvetang, Ulrich Martin, Zoltán Ivics, Zsuzsanna Izsvák, J.V. García‐Pérez, Geoffrey J. Faulkner, Tara Hurst, Aris Katzourakis, Gkikas Magiorkinis, Kerstin Schott, Rita Derua, Janna Seifried, Andreas Reuter, Heike Schmitz, Christiane Tondera, Alberto Brandariz-Núñez, Felipe Diaz‐Griffero, Veerle Janssens, Renate König, Hanna‐Mari Baldauf, Lena Stegmann, Sarah-Marie Schwarz, Maud Trotard, Margarethe Martin, Gina Lenzi, Manja Burggraf, Xiaoyu Pan, Oliver I. Fregoso, Efrem S. Lim, Libin Abraham, Elina Erikson, Laura Nguyen, Ina Ambiel, Frank Rutsch, Baek Kim, Michael Emerman, O. Fackler, Sabine Wittmann, Rayk Behrendt, Bianca Volkmann, Kristin Eissmann, Thomas Gramberg, Sebastian Bolduan, Herwig Koppensteiner, Stefanie Regensburg, Ruth Brack‐Werner, Rika Draenert, Michael Schindler, Aurélie Ducroux, Shuting Xu, Aparna Ponnurangam, Sergej Franz, Angelina Malassa, Ellen Ewald, Christine Goffinet, Sin‐Yee Fung, Ching-Ping Chan, Chun‐Kit Yuen, Kin‐Hang Kok, Chin-Ping Chan, Dong‐Yan Jin, Ulf Dittmer, Dorota Kmieć, Shilpa Iyer, Yasuo Ariumi, Mariko Yasuda-Inoue, Koudai Kawano, Satoshi Tateishi, Priscilla Turelli, Alex Compton, Nicolas Roy, Françoise Porrot, Anne Billet, Nicoletta Casartelli, Jacob S. Yount, Liang Chen, Oliver Schwartz, Carsten Magnus, Lucia Reh, Penny L. Moore, Therese Uhr, Jacqueline Weber, Lynn Morris, Alexandra Trkola, Rashel V. Grindberg, Erika Schlaepfer, Gideon Schreiber, Viviana Simon, Roberto F. Speck, Zeger Debyser, Lenard Vranckx, Jonas Demeulemeester, Suha Saleh, Eric Verdin, Anna Cereseto, Frauke Christ, Rik Gijsbers, Gang Wang, Na Zhao, Atze T. Das, Josef Köstler, Beatriz Perdiguero, Mariano Estéban, Bertram L. Jacobs, David C. Montefiori, Celia C. LaBranche, Nicole L. Yates, Georgia D. Tomaras, Guido Ferrari, Kathryn E. Foulds, Mario Roederer, Gary Landucci, Donald N. Forthal, Michael S. Seaman, Natalie Hawkins, Steven G. Self, Sanjay Phogat, James Tartaglia, Susan W. Barnett, Brian Burke, Anthony D. Cristillo, Song Ding, Jonathan L. Heeney, Giuseppe Pantaleo, Viktoria Stab, Armin Ensser, Bettina Tippler, Matthias Tenbusch, Klaus Überla, Galit Alter, Giuseppe Lofano, Anne‐Sophie Dugast, Viraj Kulkarni, Todd J. Suscovich, Tatiana Opazo, Felipe Barraza, Diego Herrera, Andrea Garcés, Tomas Schwenke, Diego León Tapia, Jorge Cancino, Gloria Arriagada, Christina Haußner, Dominik Damm, Anette Rohrhofer, Bárbara Schmidt, Jutta Eichler, Rebecca J. Midgley, J. Wheeldon, Vincent Piguet, Priyanka Khopkar-Kale, Megha Rohamare, Smita Kulkarni, Ana Godinho‐Santos, Allan J. Hance, João Gonçalves, Fabrizio Mammano, Romain Gasser, Meriem Hamoudi, Martina Pellicciotta, Zhicheng Zhou, Visdeloup Clara, Philippe Colin, Martine Braibant, Bernard Lagane, Matteo Negroni, Jula Wamara, Norbert Bannert, Thibault Mésplède, Nathan Osman, Kaitlin Anstett, Jiaming Calvin Liang, Hanh Thi Pham, Mark A. Wainberg, Wei Shao, Jigui Shan, Mary F. Kearney, Xiao‐Lin Wu, Frank Maldarelli, John W. Mellors, Brian T. Luke, John M. Coffin, Stephen Hughes, Thomas Fricke, Silvana Opp, Caitlin Shepard, Dmitri Ivanov, José Carlos Valle‐Casuso, Marine Kanja, Pierre Cappy, Daniela Lener, Ekaterina Knyazhanskaya, Andrey Anisenko, Marina Gottikh, Alexander Komkov, Anastasia A. Minervina, Gaiaz A. Nugmanov, В. И. Назаров, Konstantin Khodosevich, Ilgar Z. Mamedov, Yuri B. Lebedev, Marta Colomer-Lluch, Ruth Serra-Moreno, Ambra Sarracino, Lavina Gharu, Alexander Pasternak, Alessandro Marcello, Ann Marie McCartin, Anurag Kulkarni, Valentin Le Douce, Virginie Gautier, Ann Baeyens, Evelien Naessens, Anouk Van Nuffel, Karin Weening, Anne- Marie Reilly, Eva Claeys, Wim Trypsteen, Linos Vandekerckhove, Sven Eyckerman, Kris Gevaert, Bruno Verhasselt, Hoi Ping Mok, Nicholas Norton, Axel Fun, Jack Hirst, Mark R. Wills, Dalibor Miklík, Filip Šenigl, Jiřı́ Hejnar, Jun-ichi Sakuragi, Sayuri Sakuragi, Masaru Yokoyama, Tatsuo Shioda, Hironori Sato, Jochen Bodem, Rebecca Moschall, Sarah Denk, Steffen Erkelenz, Christian Schenk, Heiner Schaal, Norbert Donhauser, Sebastian Millen, Heinrich Sticht, Melanie C. Mann, Guochao Wei, Matthew J. Betts, Yang Liu, Timo Kehl, Robert B. Russell, Martin Löchelt, Oliver Höhn, Saeed Mostafa, Kirsten Hanke, Stephen Norley, Chia‐Yen Chen, Masashi Shingai, Pedro Borrego, Nuno Taveira, Klaus Strebel, Chris Hellmund, Melanie Friedrich, Friedrich Hahn, Christian Setz, Pia Rauch, Kirsten Fraedrich, Alina Matthaei, Petra Henklein, Maximilian Traxdorf, Torgils Fossen, Ulrich S. Schubert, Aya Khwaja, Meytal Galilee, Akram Alian, Birco Schwalbe, Michael Schreiber, Mirte Scherpenisse, Young-Keol Cho, Jung‐Eun Kim, Da-Eun Jeong, Kateřina Trejbalová, Martina Benešová, Dana Kučerová, Zdeňka Vernerová, Rachel Amouroux, Petra Hájková, Daniel Elleder, Tomáš Hron, Helena Farkašová, Padhi Abinash, Jan Pačes, Henan Zhu, Robert J. Gifford, Pablo R. Murcia, Maria Luisa Carrozza, Anna-Maria Niewiadomska, Maurizio Mazzei, Mounir R. Abi-Said, Joseph Hughes, Stéphane Hué, Adetayo Emmanuel Obasa, Graeme Jacobs, Susan Engelbrecht, Katharina Mack, Kathrin Starz, Matthias Geyer, Frédéric Bibollet‐Ruche, Marie Leoz, Jean‐Christophe Plantier, Ayele Argaw-Denboba, Emanuela Balestrieri, Annalucia Serafino, Ilaria Bucci, Chiara Cipriani, Corrado Spadafora, Paolo Sinibaldi-Vallebona, Claudia Matteucci, Srinivasan Jayashree, Ujjwal Neogi, Anil Kumar Chhangani, Shravan Sing Rathore, Bajrang Raj J. Mathur, Adeyemi Adeniyi Abati, B. Taylan Koç, Tuba Çiğdem Oğuzoğlu, Takatoshi Shimauchi, Stephan M. Caucheteux, Jocelyn Turpin, Katja Finsterbusch, Y. Tokura, Shanti Souriant, Balboa Luciana, Karine Pingris, Denise Kviatcowsky, Brigitte Raynaud‐Messina, Céline Cougoule, Ingrid Mercier, Marcelo J. Kuroda, Pablo González-Montaner, Sandra Inwentarz, Eduardo José Moraña, Marı́a del Carmen Sasiain, Olivier Neyrolles, Isabelle Maridonneau‐Parini, Geanncarlo Lugo‐Villarino, Christel Vérollet, Alexandra Herrmann, Dominique Thomas, Nerea Ferreirós Bouzas, Xavier Lahaye, Anvita Bhargava, Takeshi Satoh, Matteo Gentili, Silvia Cerboni, Aymeric Silvin, Cécile Conrad, Hakim Ahmed-Belkacem, Elisa C. Rodriguez, Jean‐François Guichou, Nathalie Bosquet, Matthieu Piel, Roger Le Grand, Megan King, Jean–Michel Pawlotsky, Nicolas Manel, Henning Hofmann, Bénédicte Vanwalscappel, Nicolin Bloch, Nathaniel R. Landau, Stanislav Indik, Benedikt Hagen, Awatef Allouch, A Baltrus David, Françoise Barré‐Sinoussi, Monsef Benkirane, Gianfranco Pancino, Asier Sáez‐Cirión, Wing-Yiu Jason Lee, Richard P. Sloan, Bianca Schulte, Jonas Blomberg, Luana Vargiu, Patricia Rodriguez‐Tomé, Enzo Tramontano, Göran Sperber, Namita Kumari, Tatiana Ammosova, Sharmeen Diaz, Patricia O’Neal, Sergei Nekhai, Audrey Fahrny, Gustavo Gers-Huber, Annette Audigé, Anitha D. Jayaprakash, Ravi Sachidanandam, Matt Hernandez, Marsha Dillon-White, Emmanuel A. Maze, Claire Ham, Neil Almond, Greg J. Towers, Robert Belshaw, Patrícia de Sousa-Pereira, Joana Abrantes, Massimo Pizzato, Pedro J. Esteves, Tanja Kahle, Sven Schmitt, Laura Merkel, Nina Reuter, Thomas Stamminger, Ilaria Dalla Rosa, Kate N. Bishop, Antonella Spinazzola, Harriet C. T. Groom, Gabrielle Vièyres, Mathias Müsken, Thomas Zillinger, Veit Hornung, Winfried Barchet, Susanne Häußler, Thomas Pietschmann, Aneela Javed, Nicole Leuchte, Gabriela Salinas, Lennart Opitz, Sieghart Sopper, Christiane Mummert, Christian Hofmann, Angela Hückelhoven, Silke Bergmann, Sandra M. Müller-Schmucker, Ellen G. Harrer, Jan Dörrie, Niels Schaft, Thomas Harrer, Laure Cardinaux, Marie-Luise Zahno, Hannelore Vogt, Reto Zanoni, Gregory Bertoni, Maximilian Muenchhoff, Philip Goulder, Stephanie Rebensburg, Markus Helfer, Yuwei Zhang, Huicheng Chen, Annie Bernier, Annie Gosselin, J.-P. Routy, Birgitta M. Wöhrl, Anna Schneider, Angela Corona, Imke Spöring, Mareike A. Jordan, B. Buchholz, Elias Maccioni, Roberto Di Santo, Kristian Schweimer, Christian Schölz, Brian T. Weinert, Sebastian Wagner, Petra Beli, Yasuyuki Miyake, Jun Qi, Lars Jensen, Werner Streicher, Anna R. McCarthy, Nicholas J. Westwood, Sonia Laı́n, Jürgen Cox, Patrick Matthias, Matthias Mann, James E. Bradner, Chunaram Choudhary, Marcel Stern, Elena Valletta, Caterina Frezza, Francesca Marino‐Merlo, Sandro Grelli, Antonio Mastino, Beatrice Macchi, Meike Kaulfuß, Sonja Windmann, Wibke Bayer, Sello Given Mikasi, Michael Storcksdieck gen. Bonsmann, Carsten J. Kirschning, Bernd Lepenies, Anne Kolenbrander, Vladimir Temchura, Kenta Iijima, Junya Kobayashi, Yukihito Ishizaka

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensJewish General HospitalInstitute of Infection and ImmunityMcGill University Health CentreUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteKarolinska Institutet
Mots-clésMedicineComputational biologyVirologyData scienceComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Question: Foamy viruses (FV), and in particular PFV, have emerged in recent years as attractive gene therapy vector candidates. Since the lack of knowledge on molecular events in FV replication is a major hurdle for broader usage of foamy virus vectors, we aimed at elucidating PFV biology by investigating interactions of its capsid protein, Gag, with host cell components. Methodology and result: To this end, we identified members of the mammalian PLK family as PFV Gag interactants in a commercial yeasttwo-hybrid (Y2H) screen and validated these results in detailed Y2H experiments for PLK1-3. In the yeast system, the intact PLK kinase and substrate recognition motifs were required for interactions with PFV Gag, in which a unique S 224 -T-P 226 motif served as a PLK binding determinant. PFV Gag mutants harbouring alanine substitutions of STP residues (iSTP) or phosphomimetic mutations of the T 225 (pmSTP) failed to interact with PLK1-3 in yeast. These findings were corroborated by colocalization studies of ectopically expressed, fluorescently tagged proteins in mammalian cells, where mCherry-tagged PFV Gag was able to recruit eGFP-tagged PLK1 and 2 to condensed mitotic chromatin in an STP motif-dependent manner. When characterizing PFV virions containing wild type or STP mutant Gag proteins, we observed that the mutations did not interfere with particle assembly, release or reverse transcription, but led to a 70 % titer reduction relative to wild type in single-round infection experiments. These replication defects became more prominent in the replication-competent PFV context. Therefore, the lack of Gag STP mutant interaction with PLK proteins upon viral entry into host cells was likely underlying this replication deficit. This hypothesis was strengthened by the finding that enzymatic PLK inhibition in host cells during transduction with wild type PFV mimicked the replication phenotype of PFV STP mutants. In addition to the overall reduced infectivity of the mutants, we also observed that the STP mutations in particle-associated Gag lead to differential sensitivity to integrase inhibition by dolutegravir and resulted in decreased integration efficiency. Conclusions: Taken together, our results demonstrate that PLK proteins influence PFV replication by virtue of their interaction with the Gag protein, ensuring timely and efficient transduction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,942

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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