Immunosuppressive Treatment Alters Secretion of Ileal Antimicrobial Peptides and Gut Microbiota, and Favors Subsequent Colonization by Uropathogenic Escherichia coli
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Transplant recipients are treated with immunosuppressive (IS) therapies, which impact host-microbial interactions. We examined the impact of IS drugs on gut microbiota and on the expression of ileal antimicrobial peptides. METHODS: Mice were treated for 14 days with prednisolone, mycophenolate mofetil, tacrolimus, a combination of these 3 drugs, everolimus, or water. Feces were collected before and after treatment initiation. Ileal samples were collected after sacrifice. Fecal and ileal microbiota were analyzed by pyrosequencing of 16S rRNA genes and enumeration of selected bacteria by culture, and C-type lectins were assessed in ileal tissues by reverse transcriptase-quantitative polymerase chain reaction. RESULTS: Prednisolone disrupted fecal microbiota community structure, decreased Bacteroidetes, and increased Firmicutes in the feces. Prednisolone, tacrolimus, and mycophenolate mofetil modified fecal microbiota at the family level in each experimental replicate, but changes were not consistent between the replicates. In ileal samples, the genus Clostridium sensu stricto was dramatically reduced in the prednisolone and combined IS drug groups. These modifications corresponded to an altered ileal expression of C-type lectins Reg3γ and Reg3β, and of interleukin 22. Interestingly, the combined IS treatment enabled a commensal Escherichia coli to flourish, and dramatically increased colonization by uropathogenic E. coli strain 536. CONCLUSIONS: IS treatment alters innate antimicrobial defenses and disrupts the gut microbiota, which leads to overgrowth of indigenous E. coli and facilitates colonization by opportunistic pathogens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».