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Enregistrement W2529381645

Addressing the Uncertainty Due to Random Measurement Errors in Quantitative Analysis of Microorganism and Discrete Particle Enumeration Data

2010· dissertation· en· W2529381645 sur OpenAlexfundno aff
Philip J. Schmidt

Notice bibliographique

RevueUWSpace (University of Waterloo) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of WaterlooCanadian Water Network
Mots-clésEnumerationStatisticsMeasurement uncertaintyMathematicsStatistical physicsComputer sciencePhysicsDiscrete mathematics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parameters associated with the detection and quantification of microorganisms (or discrete particles) in water such as the analytical recovery of an enumeration method, the concentration of the microorganisms or particles in the water, the log-reduction achieved using a treatment process, and the sensitivity of a detection method cannot be measured exactly. There are unavoidable random errors in the enumeration process that make estimates of these parameters imprecise and possibly also inaccurate. For example, the number of microorganisms observed divided by the volume of water analyzed is commonly used as an estimate of concentration, but there are random errors in sample collection and sample processing that make these estimates imprecise. Moreover, this estimate is inaccurate if poor analytical recovery results in observation of a different number of microorganisms than what was actually present in the sample. In this thesis, a statistical framework (using probabilistic modelling and Bayes’ theorem) is developed to enable appropriate analysis of microorganism concentration estimates given information about analytical recovery and knowledge of how various random errors in the enumeration process affect count data. Similar models are developed to enable analysis of recovery data given information about the seed dose. This statistical framework is used to address several problems: (1) estimation of parameters that describe random sample-to-sample variability in the analytical recovery of an enumeration method, (2) estimation of concentration, and quantification of the uncertainty therein, from single or replicate data (which may include non-detect samples), (3) estimation of the log-reduction of a treatment process (and the uncertainty therein) from pre- and post-treatment concentration estimates, (4) quantification of random concentration variability over time, and (5) estimation of the sensitivity of enumeration processes given knowledge about analytical recovery. The developed models are also used to investigate alternative strategies that may enable collection of more precise data. The concepts presented in this thesis are used to enhance analysis of pathogen concentration data in Quantitative Microbial Risk Assessment so that computed risk estimates are more predictive. Drinking water research and prudent management of treatment systems depend upon collection of reliable data and appropriate interpretation of the data that are available.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,465
Score d'incertitude au seuil0,985

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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