<i>VHL</i>-mutant renal cell carcinomas contain cancer cells with mesenchymal phenotypes.
Notice bibliographique
Résumé
4568 Background: To study “cancer stem cells” it is imperative to account for all stromal cell populations within the tumour. The existence of “cancer stem cells” in clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) has not been examined in ex vivo patient samples. Methods: We established a multiplex flow cytometry (FC) antibody panel in ccRCC, which reliably identified stromal lineages including CD45+ immune, CD31+/CD144+ endothelial and fibroblast-marker-positive subpopulations, thus allowing isolation of "lineage-negative" tumor cells. To verify the identity of tumour-derived populations as either cancer cells or normal stromal cells, we took advantage of the fact that mutations in VHL occur early during ccRCC tumorigenesis and are found in two-thirds of patients. Results: We sequenced 18 patient tumor samples, 12 of which had VHL exome mutations. Targeted re-sequencing of FC sorted subpopulations from these patients’ samples revealed that while CD45+ immune cells and CD31+/CD144+ endothelial cells were genetically normal, a population of VHL-mutant fibroblast-marker positive cells was consistently identified in every patient’s tumour. Immunohistochemistry showed that fibroblast marker-positive VHL-mutant cells do not have the large “clear cell” morphology typical of the majority of the cancer cells in these tumours. When purified and cultured, these fibroblast marker-positive VHL-mutant cells proliferate extensively under mesenchymal culture conditions, but displayed different morphologies to lineage-negative VHL-mutant tumor cells. Functional characterization of these FC sorted cell subpopulations is ongoing, including proliferation, migration, invasion, differentiation and treatment resistance. Conclusions: The phenotype and preliminary functional characterization of these VHL-mutant fibroblast-marker positive cells suggests a mesenchymal differentiation program in ccRCC, with implications for the ontogeny, biology and clinical management of VHL-mutant renal cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».