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Enregistrement W2530814035 · doi:10.1182/blood-2016-04-708560

Spectrum of somatic mutation dynamics in chronic myeloid leukemia following tyrosine kinase inhibitor therapy

2016· article· en· W2530814035 sur OpenAlexaff
Tae‐Hyung Kim, Marc S. Tyndel, Hyeoung Joon Kim, Jae-Sook Ahn, Seung Hyun Choi, Hee Jeong Park, Yeo‐Kyeoung Kim, Soo Young Kim, Jeffrey H. Lipton, Zhaolei Zhang, Dennis Dong Hwan Kim

Notice bibliographique

RevueBlood · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutationMyeloid leukemiaTyrosine-kinase inhibitorTyrosine kinaseCancer researchMedicinePersistence (discontinuity)Somatic cellBiologyImmunologyOncologyInternal medicineGeneticsReceptorCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Somatic mutations commonly detected in a variety of myeloid neoplasms have not been systematically investigated in chronic myeloid leukemia (CML). We performed targeted deep sequencing on a total of 300 serial samples from 100 CML patients; 37 patients carried mutations. Sixteen of these had evidence of mutations originating from preleukemic clones. Using unsupervised hierarchical clustering, we identified 5 distinct patterns of mutation dynamics arising following tyrosine kinase inhibitor (TKI) therapy. This study demonstrates that patterns of mutation acquisition, persistence, and clearance vary but have a number of interesting correlations with clinical outcomes. Mutation burden often persisted despite successful TKI response (pattern 1), providing indirect evidence that these mutations also originated from preleukemic mutations, whereas patients exhibiting mutation clearance (pattern 3) showed mixed clinical outcomes. Unsurprisingly, patients acquiring new mutations during treatment failed TKI therapy (pattern 2). These patterns show that CML mutation dynamics following TKI therapy are markedly distinct from other myeloid neoplasms. In summary, clinical implications of mutation profiles and dynamics in CML should be interpreted with caution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations139
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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