MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2532674537 · doi:10.1139/cjb-2016-0198

Medicinal mushroom <i>Agaricus subrufescens</i> from Iran shares genetic markers with specimens from China and Thailand

2016· article· en· W2532674537 sur OpenAlexvenueno aff
Valiollah Mahdizadeh, Naser Safaie, Ebrahim Mohammadi Goltapeh, Mohammad Reza Asef, Philippe Callac

Notice bibliographique

RevueBotany · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Biology and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyInternal transcribed spacerChinaGermplasmAgaricusMushroomEast AsiaBotanyType (biology)Range (aeronautics)Sequence analysisEvolutionary biologyRibosomal RNAGeographyGeneGeneticsEcologyArchaeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Agaricus subrufescens Peck is a cosmopolitan species of nutritional and medicinal interest. Three types of internal transcribed spacer (ITS) rDNA sequences were recently characterized for this species. Sequences of types A, B, or both types A and B are found in American and European specimens, while sequences of type C are found in Asian (China and Thailand) and Oceanian (Hawaii) specimens. We report on a collection of this species from Iran, for the first time. Both the morphological features and ITS sequence confirm its identification as A. subrufescens. Its ITS sequence was of type C and even identical to that of specimens previously reported from Hawaii, China, and Thailand. This sequence differed from those of Europe or the Americas, where most current cultivars originate. The discovery of a specimen likely native to Iran extends the known distribution range of the ITS sequence of type C from East Asia to Iran. More collections from West Asia (and elsewhere, for example Africa) would help to better know the distribution area of the different types of ITS sequences and to increase the available germplasm resources of A. subrufescens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBotanyMême sujetFungal Biology and ApplicationsTravaux en français237 207