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Enregistrement W2534754670 · doi:10.1093/hmg/ddw361

Variegated yet non-random rod and cone photoreceptor disease patterns in<i>RPGR-ORF15</i>-associated retinal degeneration

2016· article· en· W2534754670 sur OpenAlexaff
Jason Charng, Artur V. Cideciyan, Samuel G. Jacobson, Alexander Sumaroka, Sharon Schwartz, Małgorzata Świder, Alejandro J. Román, Rebecca Sheplock, Manisha Anand, Marc C. Peden, Hemant Khanna, Elise Héon, Alan F. Wright, Anand Swaroop

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteApplied Genetic Technologies CorporationMacula Vision Research Foundation
Mots-clésRetinitis pigmentosaBiologyRetinal degenerationRetinaRhodopsinRetinalOpsinDegeneration (medical)Macular degenerationOphthalmologyPathologyNeuroscienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the ORF15 exon of the RPGR gene cause a common form of X-linked retinitis pigmentosa, which often results in severe loss of vision. In dogs and mice, gene augmentation therapy has been shown to arrest the progressive degeneration of rod and cone photoreceptors. However, the distribution of potentially treatable photoreceptors across the human retinas and the rate of degeneration are not known. Here, we have defined structural and functional features of the disease in 70 individuals with ORF15 mutations. We also correlated the features observed in patients with those of three Rpgr-mutant (Rpgr-ko, Rd9, and Rpgr-cko) mice. In patients, there was pronounced macular disease. Across the retina, rod and cone dysfunction showed a range of patterns and a spectrum of severity between individuals, but a high symmetry was observed between eyes of each individual. Genotype was not related to disease expression. In the Rpgr-ko mice, there were intra-retinal differences in rhodopsin and cone opsin trafficking. In Rd9 and Rpgr-cko mice, retinal degeneration showed inter-ocular symmetry. Longitudinal results in patients revealed localized rod and cone dysfunction with progression rates of 0.8 to 1.3 log per decade in sensitivity loss. Relatively retained rod and cone photoreceptors in mid- and far-peripheral temporal-inferior and nasal-inferior visual field regions should be good targets for future localized gene therapies in patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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