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Enregistrement W2537525060 · doi:10.1016/j.immuni.2016.09.015

Antiviral CD8+ T Cells Restricted by Human Leukocyte Antigen Class II Exist during Natural HIV Infection and Exhibit Clonal Expansion

2016· article· en· W2537525060 sur OpenAlexafffund
Srinika Ranasinghe, Pedro A. Lamothe, Damien Z. Soghoian, Samuel W. Kazer, Michael B. Cole, Alex K. Shalek, Nir Yosef, R. Brad Jones, Faith Donaghey, Chioma Nwonu, Priya Jani, Gina M. Clayton, Frances Crawford, Janice White, Alana Montoya, Karen A. Power, Todd M. Allen, Hendrik Streeck, Daniel E. Kaufmann, Louis J. Picker, John W. Kappler, Bruce D. Walker

Notice bibliographique

RevueImmunity · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesSearle Scholars ProgramRagon Institute of MGH, MIT and HarvardU.S. Department of DefenseOregon Health and Science UniversityFonds de recherche du QuébecBill and Melinda Gates FoundationU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthNational Science FoundationFonds de Recherche du Québec-Société et CultureNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyCD8Human leukocyte antigenCytotoxic T cellT-cell receptorVirologyImmunologyMajor histocompatibility complexMHC class IAntigenT cellImmune systemGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD8 + T cell recognition of virus-infected cells is characteristically restricted by major histocompatibility complex (MHC) class I, although rare examples of MHC class II restriction have been reported in Cd4 -deficient mice and a macaque SIV vaccine trial using a recombinant cytomegalovirus vector. Here, we demonstrate the presence of human leukocyte antigen (HLA) class II-restricted CD8 + T cell responses with antiviral properties in a small subset of HIV-infected individuals. In these individuals, T cell receptor β (TCRβ) analysis revealed that class II-restricted CD8 + T cells underwent clonal expansion and mediated killing of HIV-infected cells. In one case, these cells comprised 12% of circulating CD8 + T cells, and TCRα analysis revealed two distinct co-expressed TCRα chains, with only one contributing to binding of the class II HLA-peptide complex. These data indicate that class II-restricted CD8 + T cell responses can exist in a chronic human viral infection, and may contribute to immune control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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