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Enregistrement W2545301885 · doi:10.1002/ece3.2563

Assessing polar bear (<i>Ursus maritimus</i>) population structure in the Hudson Bay region using <scp>SNP</scp>s

2016· article· en· W2545301885 sur OpenAlexafffundabout
Michelle Viengkone, Andrew E. Derocher, Evan S. Richardson, René M. Malenfant, Joshua M. Miller, Martyn E. Obbard, Markus Dyck, Vicki Sahanatien, Corey S. Davis

Notice bibliographique

RevueEcology and Evolution · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensTrent UniversityMinistry of Natural Resources and ForestryEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of New BrunswickGovernment of NunavutAlberta Environment and Protected AreasUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAboriginal Affairs and Northern Development CanadaEnvironment CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDirectorate for Biological SciencesAlberta InnovatesChurchill Northern Studies CentreUniversity of AlbertaParks CanadaWorld Wildlife Fund
Mots-clésBayUrsus maritimusPopulationGeographyMicrosatelliteEcologyGenetic structurePopulation geneticsBiologyZoologyArcticArchaeologyGenetic variationGeneticsDemographyAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Defining subpopulations using genetics has traditionally used data from microsatellite markers to investigate population structure; however, single‐nucleotide polymorphisms ( SNP s) have emerged as a tool for detection of fine‐scale structure. In Hudson Bay, Canada, three polar bear ( Ursus maritimus ) subpopulations (Foxe Basin ( FB ), Southern Hudson Bay ( SH ), and Western Hudson Bay ( WH )) have been delineated based on mark–recapture studies, radiotelemetry and satellite telemetry, return of marked animals in the subsistence harvest, and population genetics using microsatellites. We used SNP s to detect fine‐scale population structure in polar bears from the Hudson Bay region and compared our results to the current designations using 414 individuals genotyped at 2,603 SNP s. Analyses based on discriminant analysis of principal components ( DAPC ) and STRUCTURE support the presence of four genetic clusters: (i) Western—including individuals sampled in WH , SH (excluding Akimiski Island in James Bay), and southern FB (south of Southampton Island); (ii) Northern—individuals sampled in northern FB (Baffin Island) and Davis Strait ( DS ) (Labrador coast); (iii) Southeast—individuals from SH (Akimiski Island in James Bay); and (iv) Northeast—individuals from DS (Baffin Island). Population structure differed from microsatellite studies and current management designations demonstrating the value of using SNP s for fine‐scale population delineation in polar bears.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,618

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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