Cryptic diversity in the long‐horn moth <i>Nemophora degeerella</i> (Lepidoptera: Adelidae) revealed by morphology, <scp>DNA</scp> barcodes and genome‐wide <scp>ddRAD</scp> ‐seq data
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The growth of DNA barcode libraries has now revealed many cases of potentially cryptic diversity in various groups of generally well‐studied European Lepidoptera. In this paper, we revise a complex of cryptic species, which were formerly all classified as one species, Nemophora degeerella (Linnaeus, 1758). We found that this complex consists of three taxa: N. degeerella (Linnaeus, 1758), which is widely distributed across temperate Europe north of the Alps, from Portugal to Finland, Central Russia and Ukraine; N. scopolii sp.n. , which inhabits central and southern Europe (Slovakia, southern Germany, Austria, Slovenia and Italy); and N. deceptoriella sp.n. from the Caucasus (Russia and Georgia). These species are separated by subtle but stable external morphological characters (forewing size and pattern, relative size of the labial palpus, scapus and compound eyes) and divergent cytochrome c oxidase subunit I ( COI) lineages, with at least one geographical region (Austria to southern Germany and Slovakia) where two of these species ( N. degeerella and N. scopolii ) co‐occur. The characters of the male genitalia and four nuclear markers ( CAD , EF ‐1a, MDH and MDH ; available for two of the three taxa) did not support the separation of the taxa, but data derived from 1363 and 390 restriction‐site associated DNA sequencing ( RAD ) loci (altogether consisting of 259 311 and 71 778 bp) of four specimens of each N. degeerella and N. scopolii , which were collected mostly from the contact zone strongly supported their distinctiveness as independent lineages. Our study is one of the still quite few cases where morphological and COI analyses are supplemented with nuclear data, and one of the very first cases where next‐generation sequencing based on double‐digest RAD sequencing ( ddRAD ‐seq) methods have been applied to address taxonomic questions in insects. This published work has been registered in ZooBank : http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:FBA1953A‐412E‐4395‐BB36‐B650621DD0D0 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».