MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2545892323 · doi:10.1255/jnirs.1250

Near Infrared Spectroscopy for Rapid Estimation of Somatic Cell Counts in Human Breast Milk

2016· article· en· W2545892323 sur OpenAlexaff
Andrien A. Rackov, Kristine G. Koski, Hilary Wren, Marilyn E. Scott, Noel W. Solomons, David H. Burns

Notice bibliographique

RevueJournal of Near Infrared Spectroscopy · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMilk Quality and Mastitis in Dairy Cows
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSomatic cell countMastitisSpectroscopyNear-infrared spectroscopyWaveletMaterials scienceAnalytical Chemistry (journal)ChemistryChromatographyBiologyMedicineComputer scienceArtificial intelligencePathologyOpticsLactationPhysicsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elevated somatic cell counts (SCC) in human milk are associated with mastitis, an inflammation of the breast. However, the presence of fat globules can make the direct measurement of cells in milk challenging. We showed that near infrared (NIR) spectroscopy, a technique that has previously been used in the dairy industry for direct measurement of SCC in bovine milk, can be used for estimating SCC in human milk. Binary classification models were developed using multilinear regression with genetic algorithm searching for selection of wavelets. After correcting NIR frequency spectra for scatter contributions by fat globules and applying a Haar wavelet transform to the data, we found that multivariate classification allowed for separation of samples with low SCC (?150 K cells mL −1 ) from those with high SCC (?600 K cells mL −1 ). Sensitivity and specificity for cross-validated NIR estimates were 85% and 84%, respectively. The NIR method had very low rates of misclassification, with a model that used only two wavelets for classification. Additionally, this technique required no sample preparation and has potential as a rapid screening method for identifying elevated SCC in milk of nursing mothers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Near Infrared SpectroscopyMême sujetMilk Quality and Mastitis in Dairy CowsTravaux en français237 207