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Enregistrement W2546688631 · doi:10.3389/fncom.2016.00110

Simultaneous Bayesian Estimation of Excitatory and Inhibitory Synaptic Conductances by Exploiting Multiple Recorded Trials

2016· article· en· W2546688631 sur OpenAlexafffund
Milad Lankarany, Jaime E. Heiss, Ilan Lampl, Taro Toyoizumi

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Computational Neuroscience · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesRIKEN Brain Science InstituteRIKENFonds de Recherche du Québec - SantéJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésExcitatory postsynaptic potentialComputer scienceInhibitory postsynaptic potentialBayesian probabilityBayes' theoremInferenceArtificial intelligenceBayesian inferenceMachine learningNeuroscienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Advanced statistical methods have enabled trial-by-trial inference of the underlying excitatory and inhibitory synaptic conductances of the membrane potential recordings. Simultaneous inference of both excitatory and inhibitory conductances sheds light into the neural circuits underlying the neural activity and advances our understanding on neural information processing. Conventional Bayesian methods can infer excitatory and inhibitory synaptic conductances based on a single trial of observed membrane potential. However, if multiple recorded trials are available, this typically leads to suboptimal estimation because they neglect common statistics (of synaptic inputs) across trials. Here, we establish a new expectation maximization (EM) algorithm that improves such single-trial Bayesian methods by exploiting multiple recorded trials to extract common synaptic input statistics across the trials. In this paper, the proposed EM algorithm is embedded in parallel Kalman filters (KFs) and Particle filters (PFs) for multiple recorded trials to integrate their outputs to iteratively update the common synaptic input statistics. These statistics are then used to infer the excitatory and inhibitory synaptic conductances of individual trials. We demonstrate the superior performance of these multiple-trial Kalman Filter (MtKF) and Particle Filter (MtPF) methods relative to the corresponding single-trial methods. While relative estimation error of excitatory and inhibitory conductances is known to depend on the level of current injection into a cell, our numerical simulations using MtKF show that both excitatory and inhibitory condutances are reliably inferred using an optimal level of current injection. Finally, we validate the robustness and applicability of our technique through simulation studies and apply the MtKF algorithm to in-vivo data recorded from rat barrel cortex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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