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Enregistrement W2547905121 · doi:10.1371/journal.pone.0165951

E2F1 and TFDP1 Regulate PITX1 Expression in Normal and Osteoarthritic Articular Chondrocytes

2016· article· en· W2547905121 sur OpenAlex
Martin Pellicelli, Cynthia Picard, DaShen Wang, Patrick Lavigne, Alain Moreau

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineHôpital Maisonneuve-RosemontUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchRéseau de Recherche en Santé Buccodentaire et OsseuseF. Hoffmann-La Roche
Mots-clésChromatin immunoprecipitationGene knockdownE2F1Transcription factorE2FPromoterLuciferaseBiologyMolecular biologyTranscription (linguistics)Transcriptional regulationGene expressionGeneTransfectionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously reported a loss-of-PITX1 expression in patients suffering of knee/hip osteoarthritis (OA). Search for the mechanism underlying this event led us to discover that PITX1 repression was triggered by the aberrant nuclear accumulation of Prohibitin (PHB1), an E2F1 co-repressor, in OA articular chondrocytes. In the current study, we assessed in details the involvement of E2F transcription factors in regulating PITX1 expression. We also analyzed other genes that are similarly regulated by E2F in regard to osteoarthritis. The transcriptional regulation of the PITX1 promoter by E2F1 was analyzed with the luciferase reporter assay, and chromatin immunoprecipitation assays, which confirmed direct E2F1-PITX1 interactions. The probable binding sites for E2F1 in the PITX1 promoter were identified by DNA pulldown experiments. In silico and in vitro analyses show that the PITX1 proximal promoter region contains 2 specific sequences that are bound by E2F1. Overexpression of E2F1 enhances PITX1 promoter activity and mRNA transcription. In primary control and osteoarthritis chondrocytes, real time RT-PCR was used to measure the mRNA expression levels of candidate genes under E2F1 transcriptional control. Transcription Factor Dp-1 (TFDP1) knockdown experiments confirmed that the E2F1-TFDP1 complex regulates PITX1. Knockdown of TFDP1, an E2F1 dimerization partner, inhibits the activating effect of E2F1 and reduces both PITX1 promoter activity and mRNA transcription. Real time RT-PCR results reveal reduced expression of TFDP1 and a similar downregulation of their targets PITX1, BRCA1, CDKN1A, and RAD51 in mid-stage OA chondrocytes. Collectively, our data define a previously uncharacterized role for E2F1 and TFDP1 in the transcriptional regulation of PITX1 in articular chondrocytes. Additional E2F1 targets may be affected in OA pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle