New insights into interactions between the nucleotide‐binding domain of CFTR and keratin 8
Notice bibliographique
Résumé
The intermediate filament protein keratin 8 (K8) interacts with the nucleotide-binding domain 1 (NBD1) of the cystic fibrosis (CF) transmembrane regulator (CFTR) with phenylalanine 508 deletion (ΔF508), and this interaction hampers the biogenesis of functional ΔF508-CFTR and its insertion into the plasma membrane. Interruption of this interaction may constitute a new therapeutic target for CF patients bearing the ΔF508 mutation. Here, we aimed to determine the binding surface between these two proteins, to facilitate the design of the interaction inhibitors. To identify the NBD1 fragments perturbed by the ΔF508 mutation, we used hydrogen-deuterium exchange coupled with mass spectrometry (HDX-MS) on recombinant wild-type (wt) NBD1 and ΔF508-NBD1 of CFTR. We then performed the same analysis in the presence of a peptide from the K8 head domain, and extended this investigation using bioinformatics procedures and surface plasmon resonance, which revealed regions affected by the peptide binding in both wt-NBD1 and ΔF508-NBD1. Finally, we performed HDX-MS analysis of the NBD1 molecules and full-length K8, revealing hydrogen-bonding network changes accompanying complex formation. In conclusion, we have localized a region in the head segment of K8 that participates in its binding to NBD1. Our data also confirm the stronger binding of K8 to ΔF508-NBD1, which is supported by an additional binding site located in the vicinity of the ΔF508 mutation in NBD1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».