Glucocorticoid-induced transcriptional regulators in human airway cells and airways
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Inhaled glucocorticoids (corticosteroids) act on the glucocorticoid receptor (GR, NR3C1) to control inflammation in asthma by reducing the expression of inflammatory genes. This may involve direct repression of inflammatory gene transcription by GR and induction of anti-inflammatory genes. However, GR is a transcription factor that induces the expression of many genes, including other transcription factors. Aims: To characterize the expression of transcriptional regulators that are induced by glucocorticoids in airway epithelial cells and in the airways. Methods: Gene expression profiling of RNA from: i) primary human bronchial epithelial cells; ii) pulmonary A549 epithelial cells; and iii) BEAS-2B cells following budesonide treatment was performed using Affymetrix PrimeView microarrays. Data was compared to that from biopsies of healthy individuals 6 h following a single dose of inhaled budesonide. Selected genes were validated by qPCR. Results: Gene ontology showed up to 20% of genes upregulated by budesonide treatment in the human airways as being involved in transcription control and many of these were common with the epithelial cells. Expression of CEBPD, FOXO3, HIF3A, KLF9, KLF15, PER1, TFCP2L1, TSC22D3 and ZBTB16 were significantly upregulated in the biopsy samples and in HBE cells, with some variability between A549 and BEAS-2B, or other structural cells. Conclusion: The large number of transcriptional regulators induced by glucocorticoids indicates key roles in mediating downstream responses. Mechanistic studies are required to identify roles for these factors in the desirable therapeutic effects and/or unwanted side effects of glucocorticoids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».