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Enregistrement W2554938823 · doi:10.1183/13993003.congress-2016.pa3988

Glucocorticoid-induced transcriptional regulators in human airway cells and airways

2016· article· en· W2554938823 sur OpenAlexaff
Mahmoud Mostafa, Rider Christopher, Leigh Richard, Robert Newton

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental Science and Water Management
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlucocorticoid receptorTranscription factorMedicineDownregulation and upregulationBudesonideGlucocorticoidGene expressionRespiratory epitheliumA549 cellImmunologyGeneBiologyCell biologyCancer researchMolecular biologyEpitheliumInternal medicinePathologyLungGeneticsAsthma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Inhaled glucocorticoids (corticosteroids) act on the glucocorticoid receptor (GR, NR3C1) to control inflammation in asthma by reducing the expression of inflammatory genes. This may involve direct repression of inflammatory gene transcription by GR and induction of anti-inflammatory genes. However, GR is a transcription factor that induces the expression of many genes, including other transcription factors. Aims: To characterize the expression of transcriptional regulators that are induced by glucocorticoids in airway epithelial cells and in the airways. Methods: Gene expression profiling of RNA from: i) primary human bronchial epithelial cells; ii) pulmonary A549 epithelial cells; and iii) BEAS-2B cells following budesonide treatment was performed using Affymetrix PrimeView microarrays. Data was compared to that from biopsies of healthy individuals 6 h following a single dose of inhaled budesonide. Selected genes were validated by qPCR. Results: Gene ontology showed up to 20% of genes upregulated by budesonide treatment in the human airways as being involved in transcription control and many of these were common with the epithelial cells. Expression of CEBPD, FOXO3, HIF3A, KLF9, KLF15, PER1, TFCP2L1, TSC22D3 and ZBTB16 were significantly upregulated in the biopsy samples and in HBE cells, with some variability between A549 and BEAS-2B, or other structural cells. Conclusion: The large number of transcriptional regulators induced by glucocorticoids indicates key roles in mediating downstream responses. Mechanistic studies are required to identify roles for these factors in the desirable therapeutic effects and/or unwanted side effects of glucocorticoids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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