Mutational Analysis of Atypical Chemokine Receptor 3 (ACKR3/CXCR7) Interaction with Its Chemokine Ligands CXCL11 and CXCL12
Notice bibliographique
Résumé
Atypical chemokine receptors do not mediate chemotaxis or G protein signaling, but they recruit arrestin. They also efficiently scavenge their chemokine ligands, thereby contributing to gradient maintenance and termination. ACKR3, also known as CXCR7, binds and degrades the constitutive chemokine CXCL12, which also binds the canonical receptor CXCR4, and CXCL11, which also binds CXCR3. Here we report comprehensive mutational analysis of the ACKR3 interaction with its chemokine ligands, using 30 substitution mutants. Readouts are radioligand binding competition, arrestin recruitment, and chemokine scavenging. Our results suggest different binding modes for both chemokines. CXCL11 depends on the ACKR3 N terminus and some extracellular loop (ECL) positions for primary binding, ECL residues mediate secondary binding and arrestin recruitment potency. CXCL12 binding required key residues Asp-179 4.60 and Asp-275 6.58 (residue numbering follows the Ballesteros-Weinstein scheme), with no evident involvement of N-terminal residues, suggesting an uncommon mode of receptor engagement. Mutation of residues corresponding to CRS2 in CXCR4 (positions Ser-103 2.63 and Gln-301 7.39 ) increased CXCL11 binding, but reduced CXCL12 affinity. Mutant Q301E 7.39 did not recruit arrestin. Mutant K118A 3.26 in ECL1 showed moderate baseline arrestin recruitment with ablation of ligand-induced responses. Substitutions that affected CXCL11 binding also diminished scavenging. However, detection of reduced CXCL12 scavenging by mutants with impaired CXCL12 affinity required drastically reduced receptor expression levels, suggesting that scavenging pathways can be saturated and that CXCL12 binding exceeds scavenging at higher receptor expression levels. Arrestin recruitment did not correlate with scavenging; although Q301E 7.39 degraded chemokines in the absence of arrestin, S103D 2.63 had reduced CXCL11 scavenging despite intact arrestin responses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».