MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2556243957 · doi:10.1182/blood.v112.11.2430.2430

Functional analysis of the Human Pbx Interacting Protein (HPIP) in Human Hematopoiesis

2008· article· en· W2556243957 sur OpenAlexaff
Pawandeep Kaur, Christiane Stadler, Farid Ahmed, Monica Cusan, R. Keith Humphries, Wolfgang Hiddemann, Christian Buske, Michaela Feuring‐Buske

Notice bibliographique

RevueBlood · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Lymphoblastic Leukemia research
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTransactivationProgenitor cellStem cellHaematopoiesisMolecular biologyCell biologyCD34PopulationTranscription factorGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The recognition of novel proteins that regulate human hematopoietic stem cell and early progenitor cell fate is a prime objective in experimental and clinical hematology. Human hematopoietic PBX interacting protein (HPIP), with no significant homology to known proteins, is a 731 amino acid protein, discovered as a novel interacting partner of the PBX homeodomain protein. HPIP has been implicated as a nuclear-cytoplasmic shuttle molecule and shown to have the capacity to bind to the cytoskeleton. It also inhibits the ability of PBX-HOX heterodimers to bind to target sequences and strongly inhibits the transactivation activity of E2A-PBX1 [t(1;19) translocation, which occurs in 25% of pediatric pre-B cell acute lymphocytic leukaemia] (Abramovich C. et al JBC, 2000; Oncogene, 2002). It is highly expressed in human CD34+ progenitor cells, but is silenced in differentiated cells. To gain further insights into the possible functional role of HPIP and its domains and its possible role in a common pathway with HOX transcription co-factor PBX1, HPIP cDNA was cloned in pMSCV-IRES-YFP cassette. Umbilical cord blood enriched with CD34+ population of stem cells was obtained to perform in vitro and in vivo experiments. Mutants, with deletions of the microtubule binding region (ΔMBR-HPIP), and nuclear receptor and PBX1 interacting motif (ΔNRPID-HPIP) were generated and tested in vitro and in vivo. The constitutive expression of HPIP wt and ΔMBR-HPIP in human cord blood cells (CD34+) enhanced erythroid colony formation in CFC assay (p=0.008, n=6) while the ΔNRPID-HPIP mutant nullified the effect. Both mutants of HPIP augmented significantly, the formation of primitive colonies (GEMM and GM) in methylcellulose assay (p≤0.01, n=6) as compared to YFP control and HPIP wt. In replating CFC assays ΔNRPID-HPIP showed an increased number of myeloid colonies (p≤0.01, n=6) and GM (p=ns) colonies but a decrease in granulocytic colonies (p≤0.05, n=6) compared to YFP control and HPIP wt

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBloodMême sujetAcute Lymphoblastic Leukemia researchTravaux en français237 207