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Enregistrement W2557817225 · doi:10.1107/s2053273314094157

Structural and functional studies of Salmonella effector proteins

2014· article· en· W2557817225 sur OpenAlexaff
Caishuang Xu, Michal T. Boniecki, M.M. Cherney, Rong Shi, Mirosław Cygler

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEffectorSalmonella entericaSecretionBiologySalmonellaIntracellular parasiteCell biologyVacuoleInternalizationEndocytic cycleMicrobiologyType three secretion systemActin cytoskeletonIntracellularBacteriaVirulenceCytoskeletonCellCytoplasmBiochemistryGeneGeneticsEndocytosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gram-negative bacteria of the Salmonella enterica species are ubiquitous facultative intracellular pathogens one of the most infective in humans, causing diseases from gastroenteritis to typhoid fever. Salmonella secretes a range of proteins called effectors to gain entry and colonize the host cell. These effectors are secreted by type 3 secretion system. Upon endocytic internalization by the host cell the bacterium resides in a membrane-bound compartment – the Salmonella containing vacuole (SCV). The effector proteins prevent conversion of SCV into lysosomes and promote bacterial survival and replication within this compartment. The function of effectors varies from interfering protein synthesis and host cell signaling pathways, mediating vesicle traffic to rearranging actin cytoskeleton. We have undertaken studies of several effectors from Salmonella enterica serovar Typhimurium, such as SopD2, GtgE and SpvB, to understand their mechanism of action at the molecular level. We have expressed and purified these proteins and undertaken their crystallization. We will present our most recent results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,823
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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