SusD-like protein from the human gut bacterium Bacteroides thetaiotaomicron
Notice bibliographique
Résumé
Nutritional research is continually demonstrating the strong interaction between the human colon microbiota and a healthy digestive system 1. It has been shown that this intestinal microbial population can influence our state of health including our metabolism, nutrient production and absorption, and the development of our immune system2. These symbiotic organisms have an important role in the metabolism of human dietary carbohydrates and exist by utilizing these sugars, which are not readily digested by upstream human enzymatic mechanisms. The ability of these microbes to utilize these sugars can also impact digestive disease states that include obesity, irritable bowel disorder, colonic cancer and Type 2 diabetes3. A dominant member of this environment is the bacterium Bacteroides thetaiotaomicron and has been characterized at efficiently utilizing carbohydrates in the colon. This symbiont has been shown to have a large repertoire of proteins and enzymes that have been predicted to be strongly involved in the capture and degradation of dietary sugars. In this study we focused on assessing the impact of a specific SusD-like protein on the utilization of dietary sugars. Biochemical evidence, as well as preliminary structural data provides support that this carbohydrate binding protein is capable of binding various dietary sugars. These interactions enable this bacterium to capture sugars derived from the colon and provide an available substrate for membrane bound glycoside hydrolases. The information gathered in this study can shed light on a part of digestion that is unclear at this point in time and create a connection between diet composition and its affect on a dominant member of the gut microbiota.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».