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Enregistrement W2558470118 · doi:10.1038/ncomms13515

Structural decoding of netrin-4 reveals a regulatory function towards mature basement membranes

2016· article· en· W2558470118 sur OpenAlexafffund
Raphael Reuten, Trushar R. Patel, Matthew McDougall, Nicolas Rama, Denise Nikodemus, Benjamin Gibert, Jean‐Guy Delcros, Carina Prein, Markus Meier, Stéphanie Metzger, Zhigang Zhou, Jennifer Kaltenberg, Karen K. McKee, Tobias Bald, Thomas Tüting, Paola Zigrino, Valentin Djonov, Wilhelm Bloch, Hauke Clausen‐Schaumann, Ernst Pöschl, Peter D. Yurchenco, Martin Ehrbar, Patrick Mehlen, Jörg Stetefeld, Manuel Koch

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesMultiple Sclerosis SocietyDeutsche KrebshilfeLigue Contre le CancerNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungAgence Nationale de la RechercheDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMultiple Sclerosis Society of CanadaMelanoma Research AllianceInstitut National Du CancerCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-clésNetrinLamininAxon guidanceAngiogenesisCell biologyBasement membraneReceptorBiologyExtracellular matrixNeuroscienceAxonGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Netrins, a family of laminin-related molecules, have been proposed to act as guidance cues either during nervous system development or the establishment of the vascular system. This was clearly demonstrated for netrin-1 via its interaction with the receptors DCC and UNC5s. However, mainly based on shared homologies with netrin-1, netrin-4 was also proposed to play a role in neuronal outgrowth and developmental/pathological angiogenesis via interactions with netrin-1 receptors. Here, we present the high-resolution structure of netrin-4, which shows unique features in comparison with netrin-1, and show that it does not bind directly to any of the known netrin-1 receptors. We show that netrin-4 disrupts laminin networks and basement membranes (BMs) through high-affinity binding to the laminin γ1 chain. We hypothesize that this laminin-related function is essential for the previously described effects on axon growth promotion and angiogenesis. Our study unveils netrin-4 as a non-enzymatic extracellular matrix protein actively disrupting pre-existing BMs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,372

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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