Structural Basis of Prion Protein Conformation Conversion Inhibition
Notice bibliographique
Résumé
Prion diseases are fatal neurodegenerative diseases that affect humans and other animals. A conformational transition of the cellular prion protein, PrPC, into an infectious isoform, PrPSc, is the central event leading to aggregation and the fatal progression of these diseases. One of the therapeutic approaches for the prion diseases is the use of pharmacological chaperones. These molecules can stabilize the prion protein in its native conformation and can arrest the disease progression. Tricyclic phenothiazine compounds exhibit anti-prion activity; however, the underlying molecular mechanism of PrPSc inhibition remains elusive. We have determined the molecular structures of promazine and chlorpromazine bound to the mouse prion protein (moPrP) by forming crystals of the ternary complexes of the POM1 Fab:moPrP:promazine and the POM1 Fab:moPrP:chlorpromazine. The structures were solved by X-ray crystallography to resolutions of 1.9 Å and 2.2 Å, respectively. The small molecules are bound in a novel binding pocket formed at the intersection of the structured and the unstructured domains of the moPrP. Promazine binding induces a structural rearrangement of a portion of the unstructured region proximal to the first β-strand, β1, through the formation of a "hydrophobic anchor". We demonstrate that these molecules, promazine in particular, allosterically stabilize the misfolding initiator-motifs such as C-terminus of helix, α2, the α2-α3 loop as well as the polymorphic β2-α2 loop. Hence, the stabilization effects of the phenothiazine derivatives on initiator-motifs, induce a PrPC isoform that potentially resists oligomerization. Subtle structural differences are observed in the so-called initiator-motifs of the prion proteins that belong to many different mammalian species, and these diversities may possibly explain the generation of wide variety of scrapie strains in prion diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».