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Enregistrement W2560481339 · doi:10.1186/s13058-016-0786-1

Prediction of breast cancer risk based on common genetic variants in women of East Asian ancestry

2016· article· en· W2560481339 sur OpenAlex
Wanqing Wen, Xiao‐Ou Shu, Xingyi Guo, Qiuyin Cai, Jirong Long, Manjeet K. Bolla, Kyriaki Michailidou, Joe Dennis, Yu‐Tang Gao, Ying Zheng, Alison M. Dunning, Montserrat García‐Closas, Paul Brennan, Shou‐Tung Chen, Ji‐Yeob Choi, Mikael Hartman, Hidemi Ito, Artitaya Lophatananon, Keitaro Matsuo, Hui Miao, Kenneth Muir, Suleeporn Sangrajrang, Chen‐Yang Shen, Soo‐Hwang Teo, Chiu-Chen Tseng, Anna H. Wu, Cheng Har Yip, Jacques Simard, Paul D.P. Pharoah, Per Hall, Daehee Kang, Yong‐Bing Xiang, Douglas F. Easton, Wei Zheng

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteSeventh Framework ProgrammeNational Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Department of DefenseMinistry of Public HealthKementerian Sains, Teknologi dan InovasiMinistry of Higher Education, MalaysiaCalifornia Breast Cancer Research ProgramMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyWorld Health OrganizationCancer Research UKDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteMinistry of Education, Science and TechnologyGénome QuébecEuropean CommissionBreast Cancer Research FoundationWoodcock Institute for the Advancement of Neurocognitive Research and Applied PracticeMinistry of Health, Labour and WelfareBreast Cancer Research TrustBiomedical Research CouncilFrancis Crick InstituteVanderbilt UniversityCalifornia Department of Public HealthNational University Cancer Institute, SingaporeNational Institutes of HealthOvarian Cancer Research FundMcGill University
Mots-clésSurgical oncologyBreast cancerMedicineOncologyInternal medicineCancerDemographyBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Approximately 100 common breast cancer susceptibility alleles have been identified in genome-wide association studies (GWAS). The utility of these variants in breast cancer risk prediction models has not been evaluated adequately in women of Asian ancestry. METHODS: We evaluated 88 breast cancer risk variants that were identified previously by GWAS in 11,760 cases and 11,612 controls of Asian ancestry. SNPs confirmed to be associated with breast cancer risk in Asian women were used to construct a polygenic risk score (PRS). The relative and absolute risks of breast cancer by the PRS percentiles were estimated based on the PRS distribution, and were used to stratify women into different levels of breast cancer risk. RESULTS: We confirmed significant associations with breast cancer risk for SNPs in 44 of the 78 previously reported loci at P < 0.05. Compared with women in the middle quintile of the PRS, women in the top 1% group had a 2.70-fold elevated risk of breast cancer (95% CI: 2.15-3.40). The risk prediction model with the PRS had an area under the receiver operating characteristic curve of 0.606. The lifetime risk of breast cancer for Shanghai Chinese women in the lowest and highest 1% of the PRS was 1.35% and 10.06%, respectively. CONCLUSION: Approximately one-half of GWAS-identified breast cancer risk variants can be directly replicated in East Asian women. Collectively, common genetic variants are important predictors for breast cancer risk. Using common genetic variants for breast cancer could help identify women at high risk of breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,446
Score d'incertitude au seuil0,556

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle