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Enregistrement W2560973135 · doi:10.1002/hep.28882

Long noncoding RNA MEG3 induces cholestatic liver injury by interaction with PTBP1 to facilitate shp mRNA decay

2016· article· en· W2560973135 sur OpenAlexafffund
Li Zhang, Zhihong Yang, Jocelyn Trottier, Olivier Barbier, Li Wang

Notice bibliographique

RevueHepatology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesYale Liver CenterNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaYale UniversityUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of HealthNational Institute of Environmental Health SciencesCanadian Liver FoundationU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésBiologyMEG3Small heterodimer partnerRNALong non-coding RNAMolecular biologyTranscription factorGeneBiochemistryNuclear receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bile acids (BAs) play critical physiological functions in cholesterol homeostasis, and deregulation of BA metabolism causes cholestatic liver injury. The long noncoding RNA maternally expressed gene 3 (MEG3) was recently shown as a potential tumor suppressor; however, its basic hepatic function remains elusive. Using RNA pull‐down with biotin‐labeled sense or anti‐sense MEG 3 RNA followed by mass spectrometry, we identified RNA‐binding protein polypyrimidine tract‐binding protein 1 (PTBP1) as a MEG3 interacting protein and validated their interaction by RNA immunoprecipitation (RIP). Bioinformatics analysis revealed putative binding sites for PTBP1 within the coding region (CDS) of small heterodimer partner (SHP), a key repressor of BA biosynthesis. Forced expression of MEG3 in hepatocellular carcinoma cells guided and facilitated PTBP1 binding to the Shp CDS, resulting in Shp mRNA decay. Transient overexpression of MEG3 RNA in vivo in mouse liver caused rapid Shp mRNA degradation and cholestatic liver injury, which was accompanied by the disruption of BA homeostasis, elevation of liver enzymes, as well as dysregulation of BA synthetic enzymes and metabolic genes. Interestingly, RNA sequencing coupled with quantitative PCR (qPCR) revealed a drastic induction of MEG3 RNA in Shp−/− liver. SHP inhibited MEG3 gene transcription by repressing cAMP response element‐binding protein (CREB) transactivation of the MEG3 promoter. In addition, the expression of MEG3 and PTBP1 was activated in human fibrotic and cirrhotic livers. Conclusion : MEG3 causes cholestasis by serving as a guide RNA scaffold to recruit PTBP1 to destabilize Shp mRNA. SHP in turn represses CREB‐mediated activation of MEG3 expression in a feedback‐regulatory fashion. (H epatology 2017;65:604‐615).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,695

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations188
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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