MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2561468700 · doi:10.1158/1538-7445.am2015-lb-240

Abstract LB-240: SMARCE1 suppresses EGFR expression and controls responses to MET and ALK inhibitors in lung cancer

2015· article· en· W2561468700 sur OpenAlexaffabout
Andreas I. Papadakis, Chong Sun, Theo Knijnenburg, Yibo Xue, Wipawadee Grernrum, Michael Hölzel, Wouter Nijkamp, Lodewyk F.A. Wessels, Roderick L. Beijersbergen, René Bernards, Sidong Huang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLung cancerCancer researchGene knockdownCancerGefitinibAcquired resistanceBiologyMedicineEpidermal growth factor receptorOncologyInternal medicineGeneticsCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Recurrent inactivating mutations in components of SWI/SNF chromatin-remodelling complexes have been identified across cancer types, supporting their roles as tumour suppressors in modulating oncogenic signalling pathways. We report here that SMARCE1 loss induces EGFR expression and confers resistance to MET and ALK inhibitors in non-small cell lung cancers (NSCLCs). We found that SMARCE1 binds to regulatory regions of the EGFR locus and suppresses EGFR transcription in part through regulating expression of Polycomb Repressive Complex component CBX2. Addition of the EGFR inhibitor gefitinib restores the sensitivity of SMARCE1 knockdown cells to MET and ALK inhibitors in NSCLCs. Our findings link SMARCE1 to EGFR oncogenic signalling and suggest targeted treatment options for SMARCE1 deficient tumours. ACKNOWLEDGEMENTS: *Equal contribution. #Corresponding authors. This work was supported by grants from Canadian Institutes of Health Research (CIHR) grant MOP-130540 (S.H.), Canada Research Chair (CRC), the European Research Council (ERC), the Dutch Cancer Society (KWF), the EU COLTHERES project and grants by the Netherlands Organization for Scientific Research (NWO) to the Cancer Genomics Center Netherlands (CGC.NL). Citation Format: Andreas Papadakis*, Chong Sun*, Theo Knijnenburg, Yibo Xue, Wipawadee Grernrum, Michael Hölzel, Wouter Nijkamp, Lodewyk Wessels, Roderick Beijersbergen, Rene Bernards#, Sidong Huang#. SMARCE1 suppresses EGFR expression and controls responses to MET and ALK inhibitors in lung cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr LB-240. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-LB-240

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,522

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetChromatin Remodeling and CancerTravaux en français237 207