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Enregistrement W2561771176 · doi:10.1021/acs.jmedchem.6b01516

Design and Synthesis of a Series of <scp>l</scp>-<i>trans</i>-4-Substituted Prolines as Selective Antagonists for the Ionotropic Glutamate Receptors Including Functional and X-ray Crystallographic Studies of New Subtype Selective Kainic Acid Receptor Subtype 1 (GluK1) Antagonist (2<i>S</i>,4<i>R</i>)-4-(2-Carboxyphenoxy)pyrrolidine-2-carboxylic Acid

2016· article· en· W2561771176 sur OpenAlexafffund
Niels Krogsgaard‐Larsen, Claudia G. Delgar, Karina Koch, Patricia M.G.E. Brown, Charlotte Møller, Liwei Han, Tri H. V. Huynh, Stinne W. Hansen, Birgitte Nielsen, Derek Bowie, Darryl S. Pickering, J.S. Kastrup, Karla Frydenvang, Lennart Bunch

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesSeventh Framework ProgrammeDanish Agency for Science and Higher EducationFonds de Recherche du Québec - SantéDanmarks Frie ForskningsfondLundbeckfondenKøbenhavns Universitet
Mots-clésChemistryIonotropic effectStereochemistryGlutamate receptorReceptorBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ionotropic glutamate receptor antagonists are valuable tool compounds for studies of neurological pathways in the central nervous system. On the basis of rational ligand design, a new class of selective antagonists, represented by (2 S,4 R )-4-(2-carboxyphenoxy)pyrrolidine-2-carboxylic acid ( 1b ), for cloned homomeric kainic acid receptors subtype 1 (GluK1) was attained ( K i = 4 μM). In a functional assay, 1b displayed full antagonist activity with IC 50 = 6 ± 2 μM. A crystal structure was obtained of 1b when bound in the ligand binding domain of GluK1. A domain opening of 13–14° was seen compared to the structure with glutamate, consistent with 1b being an antagonist. A structure–activity relationship study showed that the chemical nature of the tethering atom (C, O, or S) linking the pyrrolidine ring and the phenyl ring plays a key role in the receptor selectivity profile and that substituents on the phenyl ring are well accommodated by the GluK1 receptor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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