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Enregistrement W2562489671

Characterizing the Molecular Mechanisms Involved in the Formation of Multidrug-tolerant Persister Cells in Streptococcus mutans

2015· dissertation· en· W2562489671 sur OpenAlexfundno aff
Vincent Leung

Notice bibliographique

RevueTSpace (University of Toronto) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMultidrug toleranceStreptococcus mutansMicrobiologyMultiple drug resistanceBiologyComputational biologyChemistryBiofilmGeneticsDrug resistanceBacteria
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial populations contain a small fraction of specialized dormant cells known as persisters that ensure survival from killing by all antibiotics currently in use. These multidrug-tolerant persisters are phenotypic variants that withstand cell death from antibiotics due to inactive cellular processes that most conventional antibiotics target, and are capable of reverting to normal growing cells upon the removal of antibiotics. Thus, persisters are a major contributor in resiliency of chronic microbial infections towards antibiotic therapy. Streptococcus mutans utilizes quorum-sensing for coordinating and regulating bacterial behaviors and adaptive responses at a population-wide level. Previous work has shown that this cariogenic pathogen utilizes its CSP-ComDE quorum-sensing system to direct its stress response for survival. Our objectives were to investigate the nonheritable persister phenotype in S. mutans, and to identify the molecular mechanisms by which it forms these multidrug-tolerant persisters. Persister formation in S. mutans was found to be regulated by multiple mechanisms, including two toxin-antitoxin systems, genes involved in transcription/replication, sugar metabolism, cell wall synthesis, and energy metabolism. Furthermore, we identified that the inducible CSP ‘alarmone’, the peptide pheromone responsible for communicating stress and triggering adaptive responses in the population, is important for the induction of persister formation. We demonstrated that this inducible mechanism is regulated by a CSP-inducible gene encoding a transcriptional repressor that is responsible for regulating DNA damage tolerance and identified novel persister genes that contribute to the formation of quorum-sensing-induced persister cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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