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Enregistrement W2562886398 · doi:10.1080/07060661.2016.1262901

Virulence of isolates of <i>Ustilago tritici</i> collected in Manitoba and Saskatchewan, Canada, from 1999 to 2007

2016· article· en· W2562886398 sur OpenAlexaffvenueabout
J. G. Menzies

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceBiologyInoculationPathogenHost (biology)PopulationVeterinary medicineAnthesisCultivarAgronomyMicrobiologyHorticultureGeneticsGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breeding for resistance to the loose smut pathogen, Ustilago tritici, in wheat is a traditional disease management approach in western Canada. The development of resistant wheat lines relies on accurate methods for identification of effective host resistance. Knowledge of the virulence frequencies of races in the pathogen population is essential to identify effective host resistance. The objective of this work was to characterize the virulence phenotypes of U. tritici isolates collected from 1999 to 2007 in Manitoba and Saskatchewan. Sixty-four isolates of U. tritici from durum wheat and 59 from hexaploid wheat were assessed for virulence. Teliospore suspensions of each isolate were injected into florets of the wheat differential host series by needle inoculation at mid-anthesis. Mature seed from inoculated florets were grown to determine the per cent infected plants. Eighty-five per cent of durum wheat isolates were race T32, possessing virulence to differential lines ‘Mindum’ (TD-1), and ‘Wakooma’ (TD-19). Virulence to ‘Pentad’ (TD-11) was found in only 5% of the durum wheat isolates. Races T7, T5, T64 and T10 were the most commonly identified races from the hexaploid wheat isolates of U. tritici. Six previously unreported races were identified: races T61, T64, T65, T66, T67 and T68. None of the isolates possessed virulence to ‘Sonop’ (TD-14), while >50% of the isolates possessed virulence to ‘Kota’ (TD-4), ‘Little Club’/‘Reward’ (TD-5A), ‘Reward’ (TD-7) and ‘Thatcher’/‘Regent’/‘Reward’ (TD-12A). Virulence to TD-6, which was previously uncommon from Manitoba and Saskatchewan, was possessed by 20% of the hexaploid wheat isolates. The natural population of U. tritici in Manitoba and Saskatchewan continues to evolve in terms of virulence, but effective sources of resistance are still currently available.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,158
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,169
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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