Abstract 4762: ITPKA expression in lung and other cancers, regulated via gene body methylation, functions as an oncogene
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Inositol-Trisphosphate 3-Kinase A (ITPKA), a kinase with limited tissue distribution, is involved in inositol phosphate metabolism. We identified ITPKA as up-regulated in lung and many other types of cancers. Using gain-of-function and loss-of-function approaches, we demonstrated by in vitro and in vivo assays that ITPKA functions as an oncogene to drive the development of lung cancer. We further showed that methylation level in the ITPKA gene body is significantly higher in various types of primary tumors than in corresponding non-malignant tissues, which was positively correlated with its expression. Our study revealed that DNMT3B-mediated methylation of the CpG island in ITPKA gene body regulates its expression via modulation of the binding of transcription activator SP1 to the ITPKA promoter. During the multistage pathogenesis of lung carcinoma, ITPKA gene body methylation first appeared at the in situ carcinoma stage and increased during disease progression. Thus ITPKA expression functions as an oncogene in lung and other cancers. Highly specific and sensitive expression and methylation of ITPKA was present in a wide range of tumor types, suggesting that deregulation of ITPKA may function as a universal or near universal hallmark of malignancy. Citation Format: Yi-Wei Wang, Xiaotu Ma, Yu-An Zhang, Mei-Jung Wang, Yasushi Yatabe, Stephen Lam, Luc Girard, Jeou-Yuan Chen, Adi F. Gazdar. ITPKA expression in lung and other cancers, regulated via gene body methylation, functions as an oncogene. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr 4762. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-4762
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».