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Enregistrement W2563446875 · doi:10.1194/jlr.p068833

Unsupervised analysis of combined lipid and coagulation data reveals coagulopathy subtypes among dialysis patients

2016· article· en· W2563446875 sur OpenAlexfundno aff
Daniel Contaifer, Daniel Carl, Urszula Osinska Warncke, Bassem M. Mohammed, Benjamín Van Tassell, Donald F. Brophy, Charles E. Chalfant, Dayanjan S. Wijesinghe

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSphingolipid Metabolism and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteSCIEXU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésSphingolipidHemodialysisPeritoneal dialysisMedicineDialysisInternal medicineCoagulationCoagulopathyEnd stage renal diseaseGastroenterologyDiseaseIntensive care medicineCardiologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hemodialysis (HD) and peritoneal dialysis (PD) are the primary means of managing end stage renal disease (ESRD). However, these treatment modalities are associated with the onset of coagulation abnormalities. Effective management of coagulation risk among these patients requires the identification of surrogate markers that provide an early indication of the coagulation abnormalities. The role of sphingolipids in the manifestation and prediction of coagulation abnormalities among dialysis patients have never been investigated. Herein, we report the first instance of an in depth investigation into the sphingolipid changes among ESRD patients undergoing HD and PD. The results reveal distinct differences in terms of perturbations to specific sphingolipid biosynthetic pathways that are highly dependent on the treatment modality. Our studies also demonstrated strong correlation between specific sphingolipids and coagulation parameters, such as HexCer(d18:1/26:0) and maximal amplitude (MA), SM(d18:1/24:1) and tissue factor pathway inhibitor, and sphingosine 1-phosphate d18:1 and FX (Spearman ρ of 0.93, 0.89, and −0.89, respectively). Furthermore, our study revealed the potential for using HexCer(d18:1/22:0), HexCer(d18:1/24:0), and HexCer(d18:1/26:0) (r 2 = 0.71, 0.82, and 0.63, respectively) and coagulation parameter MA (r 2 = 0.7) for successful diagnosis of differential coagulopathies among ESRD patients undergoing HD, providing an opportunity toward personalized disease management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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