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Enregistrement W2566152973

Understanding cyst-theca relationships in freshwater dinoflagellates

2013· article· en· W2566152973 sur OpenAlexaboutno aff
Francine M.G. McCarthy, Kenneth Neil Mertens, Yoshihito Takano, Andrea M. Krueger, Martin J. Head

Notice bibliographique

RevueGhent University Academic Bibliography (Ghent University) · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueGeology and Paleoclimatology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDinoflagellateThecaBiologyTaxonomy (biology)CystEcologyZoologyPopulationBotanyPathology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The resting cysts of several extant species of freshwater dinoflagellate assigned to three genera (Peridinium, Parvodinium, and Gonyaulax) are known to fossilize. They are found as part of the palynofacies in pollen preparations and have been shown to record paleolimnological conditions, e.g. productivity, pH, temperature. The cysts produced by freshwater dinoflagellates also appear to be of taxonomic importance- perhaps even more so than the cysts of their marine counterparts are to the taxonomy or marine dinoflagellate species. Despite these attributes they have received little attention, in large part because cyst-theca relationships remain relatively poorly known (with resting cysts described for only 84 of the ~350 dinoflagellate species known from freshwater environments) (Mertens et al., 2012). Although cyst-theca relationships have commonly been inferred on the basis of co-occurrence in the same water body, the motile thecate population at any given time may bear little resemblance to the long-lived seed bank of resting cysts. In Lake Xiaolongwan, China, for instance, small, brown, unornamented cysts were abundant in recent sediments, but these did not appear to be have been formed by either species of dinoflagellate found in the water column of that lake. Chu et al. (2008) suggested a possible affinity with Parvodinium inconspicuum (Lemmermann) Carty based on gross thecal morphology, but the cysts in the sediment are more similar to cysts of Parvodinium umbonatum (Stein) Carty identified by Tardio et al. (2006) than to those assigned to Parvodinium inconspicuum by McCarthy and Krueger (in press). This latter cyst-theca relationship was established due to the extraordinary preservation of thecae in varved sediments from Crawford Lake as well as inadvertent germination of cysts from a few samples during processing. The germination of cysts in these samples also allowed the assignment of cysts previously identified as “Peridinium willei small” to Peridinium volzii Lemmermann. The most rigorous way to establish cyst-theca relationships in extant dinoflagellates is by controlled germination of cysts together with single-cell PCR. This also allows the establishment of LSU/SSU rDNA-based phylogenies. This approach allowed confirmation that the affinity of large cysts common in sediments from Georgian Bay, Canada, is to Peridinium willei Huitfeldt-Kaas (McCarthy et al., 2011). Recently, LSU and SSU rDNA analysis of single cysts of Peridinium wisconsinense Eddy demonstrated that this species is very different from other species of Peridinium Ehrenberg, and is close to the species Chimonodinium lomnickii Craveiro et al. These very distinctive cysts are restricted to North American lakes, but this species may date back to the Miocene based on nearly identical cysts described from the nonmarine Tertiary of Alaska as Geiselodinium tyonekensis sp. nov. by Engelhardt (1976).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Bibliométrie, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0150,015
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,125 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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