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Enregistrement W2569824063 · doi:10.1182/blood.v106.11.1631.1631

The Risk of Dialysis Access Thrombosis Is Related to Polymorphisms in the Transforming Growth Factor-β1 and Plasminogen Activator Inhibitor-Type 1 Genes.

2005· article· en· W2569824063 sur OpenAlexaff
Alejandro Lazo‐Langner, Greg Knoll, Philip S. Wells, Rachel M. Pilkey, Nancy Carson, Marc Rodger

Notice bibliographique

RevueBlood · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasminogen activator inhibitor-1Plasminogen activatorThrombophiliaThrombosisInternal medicineTransforming growth factorHaplotypeMedicineImmunologyBiologyGenotypeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background. Transforming growth factor-β1 (TGF-β1) is involved in cell growth and differentiation and it plays an important role in the genesis of fibrosis through the stimulation of neointima proliferation and accumulation of components of the extracellular matrix and it has been suggested that polymorphisms (polym) in its gene contribute to determining the patency of the vascular access (VA) in patients (pts) on hemodialysis (HD) by contributing to both atherogenesis and VA thrombosis. On the other hand it has been demonstrated that polym in the gene encoding the plasminogen activator inhibitor type-1 (PAI-1) are a risk factor for ischemic heart disease and possibly stroke although their role in other vascular territories is unknown. It is also known that TGF-β1 is an important up-regulator of the PAI-1 gene. Methods. We conducted a case-control study to determine the relationship between TGF-β1 polym of the signal sequence (869 T>C; 915 G>C) and VA thrombosis in 416 HD pts. (107 with VA thrombosis, 309 controls had no thrombosis). We also explored for possible interactions with the 4G/5G polym of the PAI-1 gene. TGF-β1 and PAI-1 polym were amplified using PCR and genotyped using an ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer. TGF-β1 producing haplotypes (haplo) were defined as low, intermediate or high as previously reported. All pts were also tested for thrombophilia. Statistical analysis was done using univariate and multivariate logistic regression adjusted for thrombophilia, age, access type, etc. Results. Frequencies for low, intermediate and high TGF-β1 producing haplo were 9.3, 26.2 and 64.5% in cases and 2.6, 22.3 and 75.1% in controls. Odds of thrombosis for TGF-β1 haplotypes Haplotype Crude OR (95% CI) p Adjusted OR (95% CI) p High producing haplotype is reference category Low 5.11 (1.93, 13.5) 0.001 7.31 (2.15, 24.88) 0.001 Intermediate 1.30 (0.74, 2.29) 0.36 1.39 (0.70, 2.75) 0.35 Figure Figure Frequencies for 5G/5G, 4G/5G and 4G/4G PAI-1 polym. were 21.5, 56.1 and 22.4% in cases and 25.6, 50.2 and 24.3% in controls respectively. When we explored the interaction between both gene polym we found a highly significant result for the interaction between the low TGF-β1 producers and the 4G/4G PAI-1 polym (adjusted OR 19.3; 95% CI 2.82, 132.40; p=0.003). Conclusions. Our results show that intermediate and high producing TGF-β1 haplo have a protective effect against VA thrombosis in HD patients that is not modified by PAI-1 polym and also suggest that the interaction between low TGF-β1 producing haplo and the 4G/4G PAI-1 polym might be an important contributor to thrombosis of the VA in HD pts. Further studies are ongoing to determine the relationship between TGF-β1 haplo, TGF-β1 level, and PAI-1 polym with thrombosis in this and other populations as well as to clarify the mechanisms underlying this apparently paradoxical effect.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
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