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Enregistrement W2571213226 · doi:10.1111/jeu.12391

Beyond the “Code”: A Guide to the Description and Documentation of Biodiversity in Ciliated Protists (Alveolata, Ciliophora)

2017· review· en· W2571213226 sur OpenAlexaff
Alan Warren, David J. Patterson, Micah Dunthorn, John C. Clamp, Undine E.M. Achilles‐Day, Erna Aescht, Saleh Alfarraj, Saleh Al‐Quraishy, Khaled A. S. Al‐Rasheid, Martin Carr, John Day, Marc Dellinger, Hamed A. El‐Serehy, Yangbo Fan, Feng Gao, Shan Gao, Jun Gong, Renu Gupta, Xiaozhong Hu, Komal Kamra, Gaytha A. Langlois, Xiaofeng Lin, Diana Lipscomb, Christopher S. Lobban, Pierangelo Luporini, Denis H. Lynn, Honggang Ma, Miroslav Macek, Jacqueline Mackenzie‐Dodds, Seema Makhija, Robert I. Mansergh, Mercedes Martín‐Cereceda, Nettie Mcmiller, D. J. S. Montagnes, Svetlana V. Nikolaeva, Geoffrey Odhiambo Ong’ondo, Blanca Pérez‐Uz, Jasmine Purushothaman, Pablo Quintela‐Alonso, Johana Rotterová, Luciana F. Santoferrara, Chen Shao, Zhuo Shen, Xinlu Shi, Weibo Song, Thorsten Stoeck, Antonietta La Terza, Adriana Vallesi, Mei Wang, Thomas Weisse, Krzysztof Wiąckowski, Lei Wu, Kuidong Xu, Zhenzhen Yi, Rebecca A. Zufall, Sabine Agatha

Notice bibliographique

RevueJournal of Eukaryotic Microbiology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesInternational Research Center for Neurointelligence, University of TokyoNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiodiversityBiologyDocumentationTaxonomy (biology)MetadataData scienceResource (disambiguation)EcologyEnvironmental resource managementComputer scienceWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent advances in molecular technology have revolutionized research on all aspects of the biology of organisms, including ciliates, and created unprecedented opportunities for pursuing a more integrative approach to investigations of biodiversity. However, this goal is complicated by large gaps and inconsistencies that still exist in the foundation of basic information about biodiversity of ciliates. The present paper reviews issues relating to the taxonomy of ciliates and presents specific recommendations for best practice in the observation and documentation of their biodiversity. This effort stems from a workshop that explored ways to implement six Grand Challenges proposed by the International Research Coordination Network for Biodiversity of Ciliates (IRCN-BC). As part of its commitment to strengthening the knowledge base that supports research on biodiversity of ciliates, the IRCN-BC proposes to populate The Ciliate Guide, an online database, with biodiversity-related data and metadata to create a resource that will facilitate accurate taxonomic identifications and promote sharing of data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,709
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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