Identification of ALS5/SPG11/ <i>KIAA1840</i> Mutations in Patients with Autosomal Recessive Form of Charcot-Marie-Tooth Disease Type 2 (S44.002)
Notice bibliographique
Résumé
Objective: This study focused on the ALS5/SPG11/KIAA1840 screening in 28 unrelated pedigrees with autosomal recessive axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease (ARCMT2), recruited in Italy, Brazil, Canada, England, Iran, and Japan. Background: Mutations in the ALS5/SPG11/KIAA1840 gene are common cause of autosomal recessive form of hereditary spastic paraplegia (ARHSP) with thin corpus callosum (TCC) and account for approximately 40[percnt] of autosomal recessive juvenile amyotrophic lateral sclerosis (ARJALS). We extended the genetic analyses of ALS5/SPG11/KIAA1840 to CMT patients, especially those with the AR axonal form. Design/Methods: The diagnosis was based on clinical findings and familiar history. Clinical and instrumental functional analyses consist of neurological assessment, neuroimaging, electroneurographic assay, and sural nerve biopsy. Molecular studies include linkage analysis, Sanger sequencing, RFLP analysis, and bioinformatics. Results: All known ARCMT2 loci, genes causing ARHSP with TCC and genes causing ARCMT2, as well as the causative gene of peripheral neuropathy with or without agenesis of the corpus callosum were screened out. Linkage study of all families showed homozygous haplotypes and produced positive logarithm of odds score in all affected subjects. Sanger sequencing identified 15 ALS5/SPG11/KIAA1840 pathological mutations in 12 families. All pathological sequence changes were absent in controls. Two mutations were never reported before and in silico analysis predicted their pathogenetic effect. Co-segregation of each mutation with the disease was confirmed. Conclusions: Our results indicate that ALS5/SPG11/KIAA1840 is the causative gene of a wide spectrum of clinical features, including ARCMT2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».