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Enregistrement W2578409681 · doi:10.1002/cbic.201600708

An Exceptionally Selective DNA Cooperatively Binding Two Ca<sup>2+</sup> Ions

2017· article· en· W2578409681 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChina Scholarship Council
Mots-clésDNAChemistryIonBiophysicsCombinatorial chemistryBiochemistryBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ca 2+ is a highly important metal ion in biology and in the environment, and thus there is extensive work in developing sensors for Ca 2+ detection. Although many Ca 2+ ‐binding proteins are known, few nucleic acids can selectively bind Ca 2+ . DNA‐based biosensors are attractive for their high stability and excellent programmability. We report a RNA‐cleaving DNAzyme, EtNa, cooperatively binding two Ca 2+ ions but to only one Mg 2+ . Four DNAzymes with known Ca 2+ ‐dependent activity were compared, and the EtNa had the best selectivity for Ca 2+ . The EtNa is 90 times more active in Ca 2+ than in Mg 2+ . Phosphorothioate (PS) modification showed that both non‐bridging oxygen atoms at the scissile phosphate contribute equally to Ca 2+ binding. The pH–rate profile suggests two concurrent deprotonation reactions. EtNa was further engineered for Ca 2+ sensing, and found to have a detection limit of 17 μ m Ca 2+ and excellent selectivity. The detection of Ca 2+ in tap water was performed, and the result was comparable with that by ICP‐MS. This study offers new fundamental insights into Ca 2+ binding by nucleic acids and improved metal selectivity by having multiple cooperative metal binding sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle