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Enregistrement W2580985654

The Hedgehog signalling pathway and its role in cancer

2001· dissertation· en· W2580985654 sur OpenAlexfundno aff
Gerald Stephen. Saldanha

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2001
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBritish Medical AssociationUniversity Hospitals of Leicester NHS TrustMcMaster University
Mots-clésHedgehog signaling pathwayHedgehogSignallingCancerSmoothenedSignalling pathwaysBiologyCancer researchComputational biologyCell biologySignal transductionGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in Hedgehog (Hh) pathway genes such as Patched1 are of established importance in Basal cell carcinoma (BCC). However, BCC is unusual because it has indolent behaviour and rarely metastasises. Hh pathway gene mutations are rare in cancers with more typical malignant behaviour, leading to the hypothesis that the pathway plays an important role in BCC but has limited importance in cancers with typical malignant behaviour. This has been addressed in three ways. First, evidence that superficial BCC is a clonal proliferation driven by alterations at the Patched1 locus was sought. Second, evidence of Wnt pathway activation in BCC was sought by looking for nuclear accumulation of -catenin, because Wnt is a putative Hedgehog pathway target gene. Third, to determine whether the Hh pathway was important in a cancer with typical malignant behaviour, breast cancer was studied. In superficial BCC, microdissection of individual tumour nests and analysis for LOH in six cases using three microsatellite markers at the Patched1 locus was performed. Only one of the microsatellites was successfully employed. In four of the cases, all nests showed no LOH and in two cases, all nests lost the same allele. Concordant patterns of allelic loss/retention within cases represented strong evidence of clonality. In addition, the two cases with LOH suggested that clonal proliferation in superficial BCCs might be driven by Patched1 alternations. Accumulation of nuclear -catenin was found in 20 out of 86 BCCs and had a significant relationship with proliferation, indicating that the Hh pathway may act through its target genes. Alternative factors influencing -catenin distribution were sought: no relationship between nuclear -catenin and expression of E-cadherin was seen and no -catenin mutations in eight cases were found. Four breast cancer cell lines and HBL100, derived from normal mammary epithelium, showed substantially lower expression of Hh pathway target genes than BCC and were unresponsive to the pathway ligand, Sonic Hh, suggesting that the pathway is not important in this tumour. However, a relationship was found between the expression of Patched1 and in vitro invasion, the importance of which is uncertain. In conclusion, these results support the hypothesis that the Hh pathway is important in BCC but not in cancers with typical malignant behaviour.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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