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Enregistrement W2583501014 · doi:10.1139/cjb-2016-0304

Salinity-regulated expression of genes involved in GABA metabolism and signaling

2017· article· en· W2583501014 sur OpenAlexafffundvenue
Adel Zarei, Greta Z. Chiu, Guanghui Yu, Christopher P. Trobacher, Barry J. Shelp

Notice bibliographique

RevueBotany · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGABA and Rice Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyWRKY protein domainMYBGene expressionArabidopsisMutantCalmodulinArabidopsis thalianaGene expression profilingBiochemistryWild typeOrnithine decarboxylase antizymeCell biologyGeneEnzymeOrnithine decarboxylase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

4-Aminobutyrate (GABA) is a nonproteinogenic amino acid that functions in stress tolerance and signaling. Here, we report that salinity stress and elevated GABA levels coincided with the induction of glutamate decarboxylase 4 (GAD4) expression in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. ecotype Col-0. In-silico and microarray analysis revealed the over-representation of binding sites for WRKY and MYB transcription factors in the GAD4 promoter, as well as their co-expression with GAD4. Transcript profiling of liquid culture-grown, wild-type plantlets subjected to salinity stress for up to two days confirmed that GAD4 expression is associated with the inducible co-expression of WRKY28, WRKY30, WRKY40, MYB2, MYB15, and MYB108, as well as calmodulin-like 37 and aluminum-activated malate transporter 2, suggesting the involvement of gene regulation, protein activation, and anion transport in GABA accumulation. Transcript profiling of shoots from soil-grown, wild-type plants and corresponding single and double GAD mutants subjected to two days of salinity stress suggests that the GABA accumulation could involve post-translational activation of pre-existing GAD1 and GAD2 by elevated cytosolic calmodulin, as well as induction of GAD4 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,815
Score d'incertitude au seuil0,144

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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