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Enregistrement W2585252128 · doi:10.1093/ofid/ofw172.931

Epidemiology and Clinical Outcomes of Serratia marcescens Infections in Adults With Cystic Fibrosis

2016· article· en· W2585252128 sur OpenAlexaffabout
Chris Lata, Michael D. Parkins, Ranjani Somayaji, Harvey Rabin, Michael G. Surette, Ashley K. Dores, Sen Han Phang, Douglas G. Storey

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of CalgaryAlberta Health Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineSerratia marcescensEpidemiologyCystic fibrosisPathogenic organismIntensive care medicineInternal medicinePediatricsMicrobiologyEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Cystic fibrosis (CF) airway infections are often viewed as being confined to a few classical pathogens such as Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Burkholderia cepacia complex, and Stenotrophomonas maltophilia. However, a range of other organisms are commonly observed in CF; organisms where the epidemiology, natural history and clinical consequences are not understood. Herein we sought to characterize Serratia marcescens infections in adults with CF. Methods. We retrospectively audited the Calgary Adult CF program clinical records to identify patients with a history of sputum S. marcescens isolation. Baseline demographics were assessed. We compared those with sustained infection to patients with only transient isolation, as well as to age and time-matched patients with no history of S. marcescens infection to identify risk factors for infection and various outcomes such as lung function decline, mortality and lung transplantation. Results. Over the study period 9.4% of patients (29/318) had sputum positive on at least one occasion for S. marcescens. While 18 patients had transient infections clearing immediately, 11 patients had sustained infection (median 9.1 months, IQR 5–30 months). Pulmonary exacerbation was only observed in 48% of cases at incident isolation and did not differ significantly between incident transient and sustained infections. From the time of incident isolation, the number of pulmonary exacerbations was significantly increased in the following year in only those with transient infection. Compared to matched controls without S. marcescens, patients with sustained infection did not differ significantly in 5-year mortality (45% versus 23%, p = 0.64) or lung transplantation (18% versus 0%, p = 0.11). Conclusion. S. marcescens was identified as a relatively common organism from sputum culture in patients with CF. Approximately one third of patients experienced prolonged carriage of the organisms in their lower airways, but none persisted indefinitely with all eventually clearing infection. No evidence of short or long-term deleterious consequences were noted in our cohort. Disclosures. All authors: No reported disclosures

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,740

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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