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Enregistrement W2586152906 · doi:10.1182/blood.v112.11.5414.5414

Relevance of α-Globin Genotyping in Patients Expressing HbH in Cord Blood: Prevalence of α-Globin Gene Deletions and α2-Globin Termination Codon Mutations in a Neonatal Hemoglobinopathy Screening Program

2008· article· en· W2586152906 sur OpenAlexaff
Vincent‐Philippe Lavallée, Denis Soulières, Xiaoduan Weng, Louise Robin, Steven N. Girard, Gilbert Cornut, Marie-Lise Audette

Notice bibliographique

RevueBlood · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensHôpital Notre-Dame
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHemoglobinopathyThalassemiaGeneticsBiologyAlpha-thalassemiaGenotypingGlobinMolecular biologyGenotypeGeneHemolytic anemiaImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: α-Thalassemia results from an heterogeneous group of disorders involving the α-Globin genes. Common deletions are responsible for 95% of cases of α-thalassemia, whereas Constant Spring mutation (Hb CS), one of the known mutations involving the termination codon of α2-globin gene, is the most common non-deletional cause of α-thalassemia worldwide. Its prevalence has never been studied in occidental countries. Patients and methods: as part of our neonatal hemoglobinopathy screening program, fetal cord blood samples are systematically tested by HPLC. When an abnormal Hb or HbH is found, α-Globin deletion is carried by multiplex-PCR. A two part observational study was done at our center based on the available data from our hemoglobinopathy screening program available since 2002. Firstly, we aimed to determine the level of Hb H present and to correlate it to a specific type of α-Globin gene deletion by m-PCR sequencing (table 1). 306 samples were analyzed and demonstrated a statistically significant difference between categories of α-globin gene deletions: 2 del cis vs 1 del, 2 del trans vs 1 del, 2 del cis vs 2 del trans (difference of means of 8.07, 4.33 and 3.75 respectively, P<0.001). With HbH ≤3.15% a CI of 95% excludes a condition other that 1 α -globin gene deletion. With Hb H ≤7.1%, a CI of 99% excludes 2 α -globin gene deletions in cis. Table 1 Deletion/allelic distribution Hb H level (range) Hb H level (means) Std Dev 1 deletion 1.0 – 12.4 2.03 1.12 2 deletions cis - 10.1 2.16 2 deletions trans - 6.35 1.5 Our second goal was to establish the prevalence of α-Globin termination codon mutation in the fetal blood sampling containing ≥1% of Hb H in absence of α-Globin gene deletion by m-PCR. 395 fetal blood samples were analysed. Of these, 59 lacked α-Globin gene deletions. 17 were excluded from our analysis for lack of personal data or DNA. The 42 remaining samples were studied by amplification of the termination codon followed by an enzymatic digestion for the recognition site TTAA. 2 samples (5%) were found to be heterozygotes for α2-globin mutation, presumably CS mutation. The small number of positive cases does not permit the conduct of a powerful statistical analysis, however the two mutated samples had a high level of Hb H (2,9%) whereas only 21% of the 42 studied samples had an Hb H ≥2%. Conclusion: These results represent a step forward in diagnosis of α-thalassemia and in identification of patients requiring particular genetic counselling based on HbH level at birth in cord blood. These results also indicate that 5% of Hb H positive/α-Globin deletion negative samples were caused by termination codon mutation in an occidental urban based population, and that it could be of interest to search for these mutations, especially when the Hb H level is high.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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