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Enregistrement W2586416523 · doi:10.2527/jas2016.94supplement474a

P3044 Characterization of exosomal immune-related micrornas in colostrum and milk from average, low and high immune responder cows

2016· article· en· W2586416523 sur OpenAlexaff
Heba Atalla, Bonnie A. Mallard, Niel A. Karrow

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColostrumImmune systemBiologyImmunologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The expression of bioactive host defense proteins in bovine colostrum and milk is regulated by miRNAs. MiRNAs are abundant in milk at different lactation stages, often enclosed within exosomes that protect them from degradation and likely allow for cell-to-cell communication. Notably, immune-related miRNA are highly expressed in milk, particularly in colostrum, with potential to regulate gut immunity of the newborn calf and humans. To date, only few studies have evaluated the expression profile of miRNAs in cow’s milk. An interesting observation with these studies was the considerable variation in the total and identified individual miRNAs. These discrepancies were explained by differences in the RNA isolation methods and the background of the cows used in the studies. While high immune responder (HIR) cows have superior colostrum quality and concentrations of bioactive proteins compared with average (A) and low (L) responders, the expression profiles of colostrum and milk miRNAs remain to be elucidated. The central hypothesis of this study is that colostrum and milk-derived exosomes containing immune-related miRNAs are differentially expressed in A and L responders compared with HIR. The objectives of the study are to: (1) establish a reliable protocol for the fractionation of colostrum and milk for further purification and isolation of exosomes-containing miRNAs, and (2) compare and validate the expression profile of colostrum and milk exosomal miRNAs from A, L and HIR. Exosomes were isolated by differential ultracentrifugation and their presence was confirmed by immunogold labeling electron microscopy. Six RNA extraction methods were compared and RNA quantity and quality were assessed by Qubit Fluorometer and bioanalyzer. The total exosomes RNA/protein isolation kit (Invitrogen) had high RNA yield and the least ribosomal contamination. Milk samples from average responders that passed the library generation quality control (four out of 10 samples) were subjected to next-generation sequencing using the Illumina mirRNA-HiSeq2500 and bioinformatics analysis. A set of identified and novel miRNAs is being selected for validation by PCR array. This study provides platform for optimal colostrum and milk exosomal miRNAs identification that is necessary for down-stream applications. These include, but are not limited to, the discovery of novel miRNAs that have the potential to be utilized as biomarkers for milk quality control or for better understanding of the molecular mechanisms that underlie the regulatory role of miRNAs in calves and humans with emphasis on the health benefit of milk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,495
Score d'incertitude au seuil0,387

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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