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Enregistrement W2586508238 · doi:10.1097/fpc.0000000000000271

Variation in CYP2A6 and nicotine metabolism among two American Indian tribal groups differing in smoking patterns and risk for tobacco-related cancer

2017· article· en· W2586508238 sur OpenAlexaff
Julie‐Anne Tanner, Jeffrey A. Henderson, Dedra Buchwald, Barbara V. Howard, Patricia Nez Henderson, Rachel F. Tyndale

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2017
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensCanada Research ChairsCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Mental Health
Mots-clésCYP2A6CotinineNicotineGenotypeLung cancerBiologyMedicineGeneticsDemographyInternal medicineOncologyMetabolismGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The Northern Plains (NP) and Southwest (SW) American Indian populations differ in their smoking patterns and lung cancer incidence. We aimed to compare CYP2A6 genetic variation and CYP2A6 enzyme activity (representative of the rate of nicotine metabolism) between the two tribal populations as these have previously been associated with differences in smoking, quitting, and lung cancer risk. PARTICIPANTS AND METHODS: American Indians (N=636) were recruited from two different tribal populations (NP in South Dakota, SW in Arizona) as part of a study carried out as part of the Collaborative to Improve Native Cancer Outcomes P50 Project. A questionnaire assessed smoking-related traits and demographics. Participants were genotyped for CYP2A6 genetic variants *1B, *2, *4, *7, *9, *12, *17, and *35. Plasma and/or saliva samples were used to measure nicotine's metabolites cotinine and 3'-hydroxycotinine and determine CYP2A6 activity (3'-hydroxycotinine/cotinine, i.e. the nicotine metabolite ratio, NMR). RESULTS: The overall frequency of genetically reduced nicotine metabolizers, those with CYP2A6 decrease-of-function or loss-of-function alleles, was lower in the NP compared with the SW (P=0.0006). The CYP2A6 genotype was associated with NMR in both tribal groups (NP, P<0.0001; SW, P=0.04). Notably, the rate of nicotine metabolism was higher in NP compared with SW smokers (P=0.03), and in comparison with other ethnic groups in the USA. Of the variables studied, the CYP2A6 genotype was the only variable to significantly independently influence NMR among smokers in both tribal populations (NP, P<0.001; SW, P=0.05). CONCLUSION: Unique CYP2A6 allelic patterns and rates of nicotine metabolism among these American Indian populations suggest different risks for smoking, and tobacco-related disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,145
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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