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Enregistrement W2586515949 · doi:10.1182/blood.v106.11.4332.4332

Overexpression of MEL1 as a Novel Fusion Partner of AML1 in the Blastic Phase of Chronic Myeloid Leukemia with the Recurrent Cryptic Translocation t(1;21)(p36.3;q22).

2005· article· en· W2586515949 sur OpenAlexaff
Sawcène Hazourli, Pierre Chagnon, Raouf Fetni, Lambert Busque, Josée Hébert

Notice bibliographique

RevueBlood · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromosomal translocationBiologyMyeloid leukemiaMolecular biologyFusion geneGeneIntronRNA splicingGeneticsCancer researchRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Located at 1p36.3, MEL1 is a member of the MDS1/EVI1 gene family and encodes a zinc finger protein with a N-terminal PR-domain. It has been proposed that the overexpression of a modified version of MEL1 lacking the PR domain is oncogenic, whereas MEL1 retaining the PR domain is anti-tumorigenic. MEL1 is known to be overexpressed in some myeloid malignancies with reciprocal translocation t(1;3)(p36.3;q21) characterized by trilineage dysplasia and poor prognosis. It is suggested that the translocation of RPN1 gene at 3q21 in the vicinity of MEL1 gene might activate MEL1 expression through an enhancer element. Here we characterized a recurrent cryptic translocation t(1;21)(p36.3;q22) that fuses MEL1 to AML1 gene in a blastic transformation of chronic myeloid leukemia (CML). Fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis with BAC/PAC clones revealed that the breakpoints are in intron 1 of MEL1 and between intron 1 and exon 8 of AML1. RT-PCR analysis showed that AML1-MEL1, but not the reciprocal MEL1-AML1 was expressed. Many splicing variants are present, and all fusions splice the 5′ end of AML1 that contains the RUNT domain with almost the entire MEL1. Furthermore two fusion transcripts contained open reading frames making possible the translation of two forms of AML1-MEL1 fusion proteins. To investigate if AML1-MEL1 leads to an inappropriate expression of MEL1 we performed a quantitative RT-PCR with primers outside and within the fused MEL1 allowing the detection of the normal and the rearranged allele respectively. Interestingly, our data show that while no normal MEL1 transcript was detected, there was an overexpression of the fused MEL1. These results suggest that similarly to AML1-EVI1 gene, overexpression of MEL1 could be regulated by the AML1 promoter in leukemic cells with the AML1-MEL1 fusion gene and might also play an important role in the progression of CML. Moreover, in contrast to previous studies showing an antioncogenic role for the PR domain, our findings indicate that in some leukemias, the overexpression of MEL1 is not restricted to the MEL1 PR-lacking form. This suggests that the mechanism by which the PR domain has his effect, is more complex than previously thought.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
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