MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2587202904 · doi:10.1093/ndt/gfw183.25

MP093STANDARDIZED ASSESSMENT OF DIGITAL RENAL BIOPSY WHOLE SLIDE IMAGES

2016· article· en· W2587202904 sur OpenAlexaff
Charlotte Gimpel, Renate Kain, Virginie Royal, Ivana Šimić, Jean–Paul Duong Van Huyen, Shane M. Meehan, Sandrine Florquin, Nadja Birk, Laura Barisoni, Franz Schaefer

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal and Vascular Pathologies
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBiopsyRenal biopsyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction and Aims: Advances in digital image acquisition, processing, and data storage are enabling whole slide imaging (WSI) to revolutionize histopathological assessment. Efficient international collaborations, development of morphologic scoring systems and case review are facilitated by online access and webinar-based meetings, without lengthy travel or mailing of unreplaceable material. In addition, digital softwares allow annotation of specific structures (glomeruli) to support the application of accurate quantitative scoring systems for correlation to clinical and genetic findings. The EURenOmics pathology study group, as part of the INTErnational digital nephRopAThology nEtwork (INTEGRATE), is devoted to implement standardization, accuracy and reproducibility of the renal biopsy morphologic profile, by participating in worldwide webinar sections. Methods: As part of the EURenomics project we collected 171 kidney biopsies from children with steroid-resistant nephrotic syndrome enrolled in 13 centers of the PodoNet registry. 652 deidentified glass slides were scanned into WSI at high resolution (40-fold magnification, Hamamatsu Nanozoomer). To implement accuracy of glomerular evaluation, glomeruli were identified and given a unique number (annotated), even if present on several sections. A scoring system developed by the NEPTUNE study group for adult nephrotic syndrome was modified, extended and specified in mutual discussions. It includes 60 glomerular descriptors, 7 tubulo-interstitial and vascular parameters as well as 16 ultrastructural and 10 immunofluorescence items. To test reproducibility the scoring was performed independently by 6 pathologists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,752
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNephrology Dialysis TransplantationMême sujetRenal and Vascular PathologiesTravaux en français237 207