MP093STANDARDIZED ASSESSMENT OF DIGITAL RENAL BIOPSY WHOLE SLIDE IMAGES
Notice bibliographique
Résumé
Introduction and Aims: Advances in digital image acquisition, processing, and data storage are enabling whole slide imaging (WSI) to revolutionize histopathological assessment. Efficient international collaborations, development of morphologic scoring systems and case review are facilitated by online access and webinar-based meetings, without lengthy travel or mailing of unreplaceable material. In addition, digital softwares allow annotation of specific structures (glomeruli) to support the application of accurate quantitative scoring systems for correlation to clinical and genetic findings. The EURenOmics pathology study group, as part of the INTErnational digital nephRopAThology nEtwork (INTEGRATE), is devoted to implement standardization, accuracy and reproducibility of the renal biopsy morphologic profile, by participating in worldwide webinar sections. Methods: As part of the EURenomics project we collected 171 kidney biopsies from children with steroid-resistant nephrotic syndrome enrolled in 13 centers of the PodoNet registry. 652 deidentified glass slides were scanned into WSI at high resolution (40-fold magnification, Hamamatsu Nanozoomer). To implement accuracy of glomerular evaluation, glomeruli were identified and given a unique number (annotated), even if present on several sections. A scoring system developed by the NEPTUNE study group for adult nephrotic syndrome was modified, extended and specified in mutual discussions. It includes 60 glomerular descriptors, 7 tubulo-interstitial and vascular parameters as well as 16 ultrastructural and 10 immunofluorescence items. To test reproducibility the scoring was performed independently by 6 pathologists.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,017 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».